Lémuriens Ringtail. Crédit :David Haring, Centre des lémuriens Duke
Une étude des bactéries présentes dans les intestins de trois espèces de lémuriens offre de nouvelles perspectives sur le rôle du régime alimentaire dans la formation de ces écosystèmes microbiens – et sur la manière dont ces microbes peuvent être liés à la santé des primates.
"Nous voulions savoir quels microbes étaient présents et ce qu'ils faisaient, " dit Erin McKenney, chercheur postdoctoral à la North Carolina State University et auteur principal d'un article sur le travail. "Nous avons trouvé, entre autres, certaines similitudes entre les lémuriens et les humains – leurs cousins primates éloignés – qui soulèvent des questions sur les microbes que nous avons associés aux problèmes de santé chez les humains. »
Les chercheurs ont étudié trois espèces de lémuriens :les lémuriens varis (Varecia variegata) et les lémuriens à queue annelée (Lemur catta), qui mangent un régime identique de fruits et légumes au Duke Lemur Center (où se trouvaient les animaux de l'étude) ; et les propithèques (Propithecus coquereli), qui mange les feuilles.
Les chercheurs ont collecté des données sur la composition nutritionnelle du régime alimentaire de chaque espèce en captivité. Ils ont ensuite utilisé des techniques de séquençage génétique pour identifier la composition bactérienne du microbiome intestinal, sur la base d'échantillons fécaux prélevés sur des représentants de chaque espèce.
Les chercheurs ont également utilisé la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire sur des échantillons fécaux pour déterminer quels produits chimiques étaient produits dans l'intestin. En analysant les bactéries présentes et les produits chimiques produits, les chercheurs ont pu déterminer comment les microbes intestinaux utilisaient le régime alimentaire de chaque lémurien.
Lémuriens varis. Crédit :David Haring, Centre des lémuriens Duke
Pour replacer ce travail dans son contexte, il est important de savoir que les lémuriens varis et ringtails ont des tripes très différentes, physiquement. Les lémuriens varis ont des tripes très simples - ils sont à peu près une ligne droite. Les ringtails ont des tripes qui ressemblent à des intestins humains – beaucoup de rebondissements. Mais les deux espèces ont des régimes alimentaires identiques en captivité. Et les chercheurs ont découvert qu'ils avaient également des microbiomes intestinaux presque identiques.
"Nous savions déjà que les humains, qui ont tous des systèmes intestinaux similaires, pourraient avoir des microbiomes intestinaux très différents s'ils avaient des régimes alimentaires différents, ", dit McKenney. "Mais cette étude nous dit que les primates avec des systèmes intestinaux très différents peuvent avoir des microbiomes intestinaux très similaires s'ils mangent des régimes identiques. Cela met en évidence l'importance de l'alimentation dans la formation de ces écosystèmes microbiens. »
En outre, les chercheurs ont découvert que les lémuriens vari et ringtail, avec leurs régimes riches en sucre, ont également cinq voies métaboliques enrichies en commun avec les humains atteints de maladie inflammatoire de l'intestin (MICI). En d'autres termes, les lémuriens et les humains atteints de MII possédaient d'abondantes suites de machines microbiennes capables d'accomplir cinq fonctions spécifiques en commun.
« Chez l'homme, on pense que ces voies métaboliques peuvent contribuer aux problèmes de santé intestinale, " dit McKenney. " Mais ces mêmes voies métaboliques chez les lémuriens ne semblent pas nuire à la santé de l'animal. Cela soulève – mais ne répond pas – quelques questions intéressantes sur le rôle de ces voies métaboliques chez l'homme. Par exemple, les microbes concernés sont-ils réellement nocifs ? Ou s'agit-il d'un cas de corrélation avec l'IBD, mais pas de causalité."
