Le Consortium Human Cell Atlas (HCA) a publié un plan pour les efforts de l'initiative internationale visant à créer une carte de référence complète de toutes les cellules humaines, un projet qui servira de base à une meilleure compréhension de la santé humaine et au diagnostic, surveillance, et le traitement de la maladie.

La publication du plan, publiée sous forme de livre blanc sur le site Web du HCA, coïncide avec la publication d'un commentaire sur Nature par le comité d'organisation du HCA résumant la vision et la mission du consortium.

En outre, le consortium a également annoncé aujourd'hui la publication imminente des profils d'expression génique du premier million de cellules immunitaires collectées dans le cadre du HCA, vers une étape initiale de collecte d'au moins 30 millions de cellules représentant plusieurs tissus et organes pour la première ébauche de l'atlas. Ces données, à publier sur un référentiel en ligne d'ici début novembre, sera disponible gratuitement pour les chercheurs.

Le plan directeur et la publication des données ont été présentés lors de la deuxième assemblée générale du HCA, hébergé par le Weizmann Institute of Science à Rehovot, Israël. La réunion célèbre le premier anniversaire du consortium et marque sa transition officielle de sa planification à sa phase opérationnelle.

« Au cours de la dernière année, la communauté scientifique internationale, des médecins aux informaticiens, s'est engagé dans un processus ouvert pour planifier la manière de réaliser cet atlas révolutionnaire, " a déclaré Aviv Regev, un membre de base, chaire de faculté, et directeur du Klarman Cell Observatory and Cell Circuits Program au Broad Institute du MIT et de Harvard; un enquêteur HHMI ; professeur de biologie au Massachusetts Institute of Technology; et coprésident, avec Sarah Teichmann du Wellcome Trust Sanger Institute, du comité d'organisation du HCA. "Ensemble, nous avons dessiné le plan. Il est maintenant temps de commencer à construire la maison."

"Les données qui seront collectées pour l'atlas, une fois terminé, fournira un point d'entrée pour une étude plus approfondie des fonctions et des interactions des cellules, à la fois dans leurs tissus d'origine et plus largement dans tout le corps, " dit Teichmann, responsable de la génétique cellulaire à l'Institut Sanger, directeur de recherche au département de physique de l'université de Cambridge, et chercheur principal au Churchill College, Cambridge. « Une telle connaissance sera, heures supplémentaires, avoir un effet transformateur sur la compréhension scientifique de la biologie humaine et sur la santé humaine. »

Plan stratégique mondial

Le HCA a été lancé en 2016 avec un objectif aussi ambitieux que le Human Genome Project :créer un catalogue de référence de toutes les cellules humaines, leurs proportions, leurs emplacements, et les interactions entre eux. Le livre blanc indique que pour la première ébauche de l'atlas, le consortium étudiera et cartographiera entre 30 et 100 millions de cellules d'organes et de tissus sélectionnés, en utilisant le séquençage d'ARN monocellulaire massivement parallèle (une suite de techniques génomiques capables d'identifier des profils d'expression génique dans des milliers de cellules individuelles à la fois), technologies connexes pour caractériser d'autres molécules, et des méthodes spatiales pour cartographier les emplacements et les interactions des cellules.

L'objectif à long terme du consortium est de profiler au moins 10 milliards de cellules couvrant tous les tissus, organes, et systèmes, représentant des tissus sains ainsi que ceux affectés par des maladies et des conditions particulières. L'atlas complet sera le plus diversifié possible, capturer un éventail de maladies, emplacements géographiques, environnements, et groupes d'âge.

Gouvernance

En plus de fixer les objectifs et la portée de la première ébauche de l'atlas, le livre blanc présente les structures organisationnelles et de gouvernance du consortium, en mettant l'accent sur la diversité scientifique et l'inclusivité. Il fournit également un ensemble de principes directeurs fondés sur l'éthique, équité, et d'ouverture, reflétant les origines scientifiques de base du consortium.

Le HCA est dirigé et gouverné par un Comité d'Organisation (CO), l'organe décisionnel de la HCA. Le CO comprend 27 scientifiques de 10 pays et est actuellement coprésidé par Aviv Regev (Broad Institute) et Sarah Teichmann (Wellcome Trust Sanger Institute). Consultez la liste complète des dirigeants de HCA ici.

« AHC a été conçu et initié par des scientifiques, et il est dirigé et dirigé par des scientifiques de 19 institutions dans 10 pays, " dit Piero Carninci, directeur de la division des technologies génomiques au RIKEN (Institut de recherche physique et chimique) au Japon et directeur adjoint du RIKEN Center for Life Science Technologies. « Déjà des dizaines de scientifiques du monde entier, y compris divers pays asiatiques, ont exprimé leur intérêt à participer et à apporter leur expertise aux études HCA.

Les données du premier million de cellules, et le chemin vers dix milliards

Les données d'expression des cellules immunitaires annoncées aujourd'hui seront disponibles dans une ressource publique en ligne d'ici début novembre, et comprennent des profils d'expression d'ARN unicellulaire d'environ un million de cellules recueillies à partir de moelle osseuse et de sang de cordon de donneurs humains sains.

Ces données d'expression seront disponibles gratuitement, permettre aux membres de la communauté scientifique d'utiliser l'information dans la recherche. L'engagement en faveur du libre accès est l'une des valeurs fondamentales du HCA, ainsi que les principales considérations éthiques.

L'Atlas des Cellules Humaines (AHC) est un consortium collaboratif international, qui vise à créer des cartes de référence complètes de toutes les cellules humaines - les unités fondamentales de la vie - comme base à la fois pour comprendre la santé humaine et diagnostiquer, surveillance, et le traitement de la maladie. Le HCA est une fondation, ouvrir les cellules de cartographie des ressources, tissus, organes et systèmes dans tout le corps. Le HCA aura un impact sur tous les aspects de la biologie et de la médecine, propulsant des découvertes et des applications translationnelles et menant finalement à une nouvelle ère de médecine de précision.