1. Comparaison morphologique: Il s'agit de la méthode traditionnelle, en comparant les caractéristiques physiques comme la structure osseuse, les systèmes d'organes et la forme globale du corps. Bien que utile pour les relations à grande échelle, il peut être trompeur en raison de l'évolution convergente (des caractéristiques similaires se développant indépendamment).
2. Preuve fossile: L'examen des enregistrements fossiles peut révéler l'histoire évolutive et la lignée trace sur de vastes échelles de temps. Cependant, les dossiers fossiles sont incomplets et les interprétations peuvent être subjectives.
3. Biologie moléculaire: Il s'agit de l'outil le plus puissant pour comprendre les relations évolutives. Il se concentre sur la comparaison:
* Séquences d'ADN: L'analyse de la similitude des séquences d'ADN entre les organismes révèle une ascendance partagée. Plus les séquences sont similaires, plus elles sont étroitement liées.
* séquences protéiques: Les protéines sont codées par l'ADN, donc la comparaison des séquences de protéines (comme le cytochrome C) peut également indiquer une parenté évolutive.
* Modèles d'expression des gènes: L'analyse de la façon dont les gènes sont activés et désactivés peuvent révéler des similitudes et des différences dans les voies de développement et les réponses à l'environnement.
4. Analyse phylogénétique: Cela implique la construction d'arbres évolutifs (phylogénie) basés sur des données de comparaisons morphologiques, fossiles et moléculaires. Des méthodes statistiques sont utilisées pour déterminer les relations évolutives les plus probables.
5. Biogéographie: L'étude de la distribution géographique des espèces peut fournir des indices sur leur histoire évolutive et leurs relations potentielles. Par exemple, les espèces des îles partagent souvent un ancêtre commun.
6. Comparaisons comportementales: L'examen des comportements partagés, comme les rituels d'accouplement ou les modèles de communication, peut fournir des informations supplémentaires sur les relations évolutives, en particulier pour les animaux.
7. Génomique: L'étude des génomes complets permet une comparaison plus complète du matériel génétique, conduisant à une compréhension plus précise des relations évolutives.
Il est important de noter que ces méthodes sont souvent utilisées en combinaison. Par exemple, les données moléculaires peuvent être utilisées pour corroborer ou contester les conclusions basées sur des observations morphologiques. De plus, de nouvelles technologies et techniques sont constamment développées, améliorant davantage notre compréhension des relations évolutives.
