Les recherches sur le génome menées par l'Université de Warwick suggèrent que la fièvre entérique, une maladie potentiellement mortelle plus fréquente dans les pays chauds, était présent dans l'Europe médiévale.

Salmonelle Paratyphi C provoque une fièvre entérique, une infection mortelle, et a été détecté dans un squelette humain de 800 ans découvert à Trondheim, Norvège.

Maintenant, les scientifiques spéculent que l'évolution de la fièvre entérique pourrait être liée à la domestication des porcs dans le nord de l'Europe.

La recherche a été menée par une équipe de collaborateurs internationaux dirigée par le professeur Mark Achtman de la faculté de médecine de Warwick de l'Université et leur article Analyse pan-génomique de Salmonella enterica ancienne et moderne démontre la stabilité génomique de la lignée Para C envahissante pour des millénaires a été publié dans le journal Biologie actuelle .

Lui et son équipe ont analysé l'ADN bactérien trouvé dans les dents et les os du squelette d'une jeune femme qui aurait migré vers Trondheim depuis les régions les plus septentrionales de la Scandinavie ou du nord-ouest de la Russie au début de son adolescence pour y mourir vers l'âge de 19 ans. -24 ans.

Ils ont reconstruit un génome de Salmonella Paratyphi C qui provoque la fièvre entérique dans les zones de mauvaise hygiène et de manque d'eau potable. Leur découverte indique que le jeune Norvégien est mort de cette maladie et suggère que ces bactéries ont longtemps causé la fièvre entérique dans le nord de l'Europe,

Le professeur Achtman a déclaré :" Paratyphi C est très rare aujourd'hui en Europe et en Amérique du Nord sauf pour les voyageurs occasionnels en provenance d'Asie du Sud et de l'Est ou d'Afrique, où la maladie est plus fréquente. C'est la première fois que des salmonelles sont découvertes dans des restes humains anciens en Europe, ce qui est surprenant car d'autres Salmonella sont plus courantes aujourd'hui, dont Salmonella causant la fièvre typhoïde, appelé Typhi, et Salmonella causant une intoxication alimentaire. Plus tôt cette année, Vågene et ses co-auteurs ont décrit Paratyphi C de squelettes au Mexique, décédé en 1545 EC, et spéculé sur le Paratyphi C sont entrés dans les Amériques avec les Européens.

Les nouveaux résultats comprenaient des analyses comparatives des Paratyphi C génome trouvé dans le squelette contre les séquences du génome de Salmonella modernes d'EnteroBase, une base de données en ligne développée à l'Université de Warwick et utilisée à l'échelle internationale. Cela a révélé que Paratyphi C représente les descendants évolutifs d'un ancêtre commun, ou clade, dans la lignée Para C. La lignée Para C comprend le choléraesuis, qui provoque une septicémie chez les porcs et les verrats et Typhisuis qui provoque une épidémie de salmonellose porcine (paratyphoïde chronique) chez les porcs domestiques. Ces différentes spécificités d'hôtes ont vraisemblablement évolué en Europe au cours des 4 dernières, 000 ans et coïncident avec le moment de la domestication des porcs en Europe.

D'après les documents historiques, les humains ont longtemps été touchés par des infections bactériennes, pourtant, les analyses génomiques d'agents pathogènes bactériens vivants estiment couramment une date pour l'ancêtre commun le plus récent de pas plus de quelques siècles. En général, les arbres évolutifs contiennent un groupe souche, qui peut inclure des lignées maintenant rares ou éteintes, ainsi que le groupe couronne d'organismes vivants. Les reconstructions historiques basées uniquement sur le groupe couronne ignorent les sous-lignées plus anciennes du groupe souche et fournissent ainsi une image incomplète de l'histoire évolutive plus ancienne du pathogène. En revanche, analyses d'ADN ancien comme le Paratyphi C Le génome peut faire la lumière sur des millénaires supplémentaires d'évolution de pathogènes bactériens qui se sont produits avant l'origine du groupe couronne.

Le professeur Achtman a ajouté :« En utilisant EnteroBase, nous avons pu définir la lignée Para C à partir de 50, 000 génomes modernes de Salmonella enterica et constatent que sur ses 3, 000 ans d'histoire, seuls quelques changements génomiques se sont produits au sein de la lignée Para C.

"En plus de remodeler notre compréhension de Salmonella enterica, nos recherches ont déclenché des spéculations intrigantes sur les sauts d'hôte historiques au cours de la période néolithique entre les humains et leurs animaux domestiques. »