Le carbone se trouve dans l’eau et les sédiments des lacs, des rivières, des ruisseaux, des estuaires, des profondeurs océaniques, des eaux souterraines et des aquifères, des calottes glaciaires et des zones humides. Le carbone dans ces systèmes aquatiques peut être classé comme matière organique dissoute, matière organique particulaire et matière inorganique ou organismes vivants comme les bactéries, les diatomées, les dinoflagellés, les poissons, les champignons, les plantes aquatiques, le zooplancton, les algues, les écrevisses, les moules, les méduses, les lions de mer, morses, requins, baleines, tortues, etc.
