Résumé :

Les manchots royaux (Aptenodytes patagonicus) sont des oiseaux incapables de voler emblématiques qui habitent les régions subantarctiques de l'océan Austral. Les îles Crozet, un archipel isolé du sud de l'océan Indien, abritent l'une des plus grandes populations reproductrices de manchots royaux. Cependant, l’histoire évolutive et les adaptations génétiques des manchots royaux des îles Crozet restent mal comprises. Dans cette étude, nous avons mené une analyse complète du génome des manchots royaux des îles Crozet afin de faire la lumière sur leurs relations évolutives, la structure de leur population et leurs adaptations génétiques.

Méthodes :

Nous avons collecté des échantillons de sang sur 50 manchots royaux des îles Crozet et extrait l'ADN génomique. Un séquençage à haut débit a été réalisé pour obtenir des données sur le génome entier de chaque individu. Nous avons assemblé le génome de novo et annoté les gènes codant pour les protéines. Des analyses phylogénétiques ont été menées pour déduire les relations évolutives entre les manchots royaux des îles Crozet et d'autres populations. Des analyses génétiques de la population ont été effectuées pour évaluer la diversité génétique et la structure de la population des îles Crozet. Des analyses pangénomiques ont été menées pour identifier les signatures de la sélection naturelle et les gènes adaptatifs potentiels.

Résultats :

Notre analyse phylogénétique a révélé que les manchots royaux des îles Crozet forment un clade génétique distinct, suggérant une longue histoire évolutive d'isolement des autres populations. L'analyse génétique de la population a indiqué un niveau relativement élevé de diversité génétique au sein de la population des îles Crozet, ce qui suggère que la population est restée stable sur une longue période. Des analyses pangénomiques ont identifié plusieurs régions du génome qui présentaient des signatures de sélection naturelle, notamment des gènes impliqués dans le métabolisme des lipides, la thermorégulation et la fonction immunitaire. Ces découvertes suggèrent que les manchots royaux des îles Crozet ont subi des adaptations génétiques pour faire face aux conditions environnementales uniques de la région subantarctique.

Conclusion :

Notre étude fournit des informations précieuses sur l’histoire évolutive et les adaptations génétiques des manchots royaux des îles Crozet. Les données et analyses génomiques présentées dans cette étude contribueront à la conservation et à la gestion de cette espèce emblématique d’oiseaux marins et nous aideront à mieux comprendre les processus évolutifs qui ont façonné la biodiversité de la région subantarctique.