Nicole Sultanum dit que l'un des moyens les plus rapides de comprendre l'information est la vue.

"Nous sommes beaucoup plus rapides à reconnaître les modèles, " dit Sultanum, un doctorat de l'Université de Toronto. étudiant au département d'informatique et son laboratoire Dynamic Graphics Project.

« S'il s'agit d'un tableau de nombres par rapport à un graphique, un graphique est beaucoup plus rapide pour que vous trouviez comment les données sont distribuées. Lorsque du texte est utilisé, les choses se compliquent un peu parce que d'une manière ou d'une autre, vous devez traduire le texte en quelque chose que l'ordinateur peut comprendre, qui est l'un des plus grands défis avec la visualisation de texte."

Sultane, dont la recherche examine la visualisation de texte à usage clinique, a récemment présenté "Doccurate:A Curation-Based Approach for Clinical Text Visualization" à la conférence IEEE VIS à Berlin.

Ses co-auteurs incluent le Dr Devin Singh, un médecin urgentiste au Hospital for Sick Children (SickKids), et ses co-encadrants diplômés en informatique, Professeur Michael Brudno et professeure adjointe Fanny Chevalier.

Brudno est un expert en médecine informatique et Chevalier est spécialisé dans la visualisation de données.

Singh, qui a terminé sa formation en résidence en pédiatrie et une bourse de deux ans en salle d'urgence pédiatrique au SickKids, ne connaît que trop bien le besoin d'outils de visualisation de texte en médecine.

"Je suis l'utilisateur final d'un outil comme celui-ci, ce qui me donne une perspective unique, " il dit.

Ses intérêts de recherche incluent la mise en œuvre de l'apprentissage automatique pour la pratique clinique, ce qui l'a amené à collaborer avec Brudno, qui est également le directeur du SickKids' Center for Computational Medicine. Brudno supervise la poursuite par Singh d'une maîtrise en informatique à l'Université de Toronto.

"Mon idée est de prendre ma compréhension de la nuance médicale, apprendre d'experts comme Nicole et créer des solutions qui comblent le fossé pour améliorer les soins aux patients, " dit Singh.

Tenir compte des contraintes de temps des médecins de famille, dit Sultanum. Ils rencontrent généralement les patients pendant 15 minutes et n'ont probablement pas plus de 15 minutes entre les patients pour examiner les dossiers. Mais si un patient avec de longs antécédents médicaux rencontre un médecin puis un autre, les chercheurs suggèrent qu'il est improbable que les deux médecins passent beaucoup de temps à lire l'historique complet du patient.

« Si vous avez un patient avec une très longue histoire, le médecin va demander au patient quels sont les faits saillants. Il n'y a aucune garantie que le patient va leur donner un description complète de leur état. Ils ne s'en souviendront peut-être pas - mais c'est dans le dossier, " elle dit.

Sultanum a observé et interrogé un certain nombre de médecins du SickKids et des cliniques de Toronto.

Leurs ensembles de données comprennent plus de 300 pages de notes de dossier médical pour chaque patient. Les conditions mentionnées dans un dossier médical sont visualisées sous forme de steamgraphs, des graphiques en forme de chaîne avec des gouttelettes qui se développent lors de la récurrence des termes. Par exemple, une gouttelette plus grosse autour de l'hypertension signifierait que c'est un problème pour le patient. Chaque condition est étiquetée avec une couleur différente.

"C'est extrêmement précieux de pouvoir regarder très rapidement un seul écran qui me montre une visualisation qui est une somme précise du dossier médical d'un patient, " dit Singh. " Je peux alors passer rapidement de l'évaluation d'un patient malade à la prise de mes décisions cliniques en toute confiance. "

Singh dit que ce qui rend Doccurate unique par rapport aux autres outils de visualisation médicale, c'est sa capacité de personnalisation. Par exemple, un caillot sanguin peut être associé à un certain nombre de maladies, mais il dit qu'il peut le classer de manière à ce que la visualisation finale corresponde à la condition médicale correcte.

"Ça m'est communiqué de manière visuelle, qui permet de relier les modèles mentaux des médecins entre eux, créer une équipe de soins holistique grâce à la visualisation."

Sultanum dit que la prochaine étape de sa recherche sera de fournir un sens visuel du récit et de la progression de la façon dont le patient a évolué au fil du temps. Elle commencera à explorer cette idée en utilisant des ensembles de données de traitement du langage naturel lors d'une visite de recherche de quatre mois à Inria Saclay, l'un des nombreux instituts français de recherche en informatique.

Faire passer Doccurate de la preuve de concept à d'autres essais cliniques est un autre défi, mais Singh pense que le moment est venu. Rien que l'été dernier, SickKids est passé au numérique avec un nouveau système d'information électronique sur la santé, Épique. Avec de plus en plus d'hôpitaux faisant progresser leurs systèmes électroniques d'information sur la santé, Doccurate aura plus de possibilités d'utilisation clinique.

"Les gens sont prêts à se poser la question 'Comment pouvons-nous utiliser ce système de dossier médical électronique et trouver d'autres valeurs ajoutées?'", dit-il.

« Nous pouvons créer un pont entre la médecine et l'informatique afin que ces types de solutions puissent être mises en œuvre pour améliorer la sécurité des patients et la qualité des soins que nous prodiguons. »