Cependant, il y a quelques exceptions:
* mitochondrie: Ces organites ont leur propre ADN, séparé de l'ADN nucléaire. Ceci est connu sous le nom de ADN mitochondrial (MtDNA).
* chloroplastes: Dans les cellules végétales, ces organites contiennent également leur propre ADN, appelé ADN chloroplastique (CPDNA).
Ainsi, alors que le noyau est l'emplacement principal de l'ADN, une petite quantité peut également être trouvée dans les mitochondries et les chloroplastes.