Ce sont les catégories les plus larges de la classification biologique et représentent les branches évolutives les plus profondes. Les trois domaines sont:
* bactéries: Procaryotes monocellulaires (sans noyau).
* Archaea: Procaryotes mono-celluriques (sans noyau) qui vivent souvent dans des environnements extrêmes.
* eukarya: Organismes avec des cellules qui ont un noyau et d'autres organites liés à la membrane. Ce domaine comprend des plantes, des animaux, des champignons et des protistes.
Dans chaque domaine, il existe d'autres classifications, notamment les royaumes, les phyla, les classes, les ordres, les familles, les genres et les espèces.