Membrane extérieure : La membrane externe d'E. coli est composée d'une couche de lipopolysaccharides qui agit comme une barrière physique contre l'acide gastrique.
Pompes à efflux : E. coli contient des pompes à efflux qui lui permettent de pomper les protons (H+) hors de la cellule, maintenant ainsi un pH neutre à l'intérieur du cytoplasme. L'efflux de protons crée un microenvironnement alcalin autour de la bactérie, la protégeant des dommages acides.
Homéostasie du pH : E. coli possède des gènes de résistance aux acides qui codent pour des protéines impliquées dans le maintien de l'homéostasie du pH. Ces protéines aident les bactéries à s'adapter aux environnements à faible pH en régulant le pH interne et en empêchant l'acidification du cytoplasme. Ce système régule l'absorption de certains solutés comme le glutamate et l'arginine pour tamponner le pH interne.
Formation de biofilm : Dans certains cas, E. coli peut former des biofilms, des communautés protectrices de bactéries qui se développent sur les surfaces. Les biofilms sont plus résistants à l’acide gastrique que les cellules bactériennes individuelles, car la matrice extracellulaire produite par le biofilm agit comme une barrière contre la pénétration de l’acide.
En employant ces mécanismes, E. coli peut survivre au passage dans l’environnement acide de l’estomac et atteindre les conditions plus hospitalières de l’intestin, où il peut se multiplier et provoquer une infection.