Les banques de gènes jouent un rôle important dans la conservation à long terme des ressources phytogénétiques pour l'alimentation et l'agriculture. Sur 1 800 collections de banques de gènes dans le monde, plus de 600 se trouvent en Europe. Cette vaste diversité de cultures ne peut être exploitée pour rendre nos cultures plus nutritives, productives et résistantes aux ravageurs, aux maladies et aux changements environnementaux, que si nous disposons d'informations à ce sujet.

Le catalogue européen de recherche de ressources phytogénétiques (EURISCO) est une base de données internationale agrégée qui fournit un point d'entrée central pour les informations sur la grande diversité génétique des cultures conservée dans plus de 400 instituts dans 43 pays européens et voisins.

Une mise à jour sur EURISCO a récemment été publiée dans Nucleic Acids Research (NAR) numéro spécial sur les bases de données biologiques.

Actuellement, plus de 2 millions d'accessions aux ressources phytogénétiques sont documentées dans EURISCO, comprenant 6 737 genres et 45 175 espèces. Il s'agit notamment des principales céréales comme le blé et le maïs, des légumineuses comme les haricots, les pois et les vesces, des oléagineux comestibles comme le tournesol et les graines de lin, des tubercules comme les pommes de terre et des Brassica.

Plus de 400 000 entrées font partie du Système multilatéral d'accès et de partage des avantages (MLS) du Traité international sur les ressources phytogénétiques pour l'alimentation et l'agriculture (ITPGRFA), ce qui signifie qu'elles ont été confirmées par les pays respectifs comme étant rapidement disponibles sous conditions de partage des avantages standard et internationalement convenues. En outre, il existe 2,6 millions d'enregistrements de données phénotypiques provenant de plus de 3 800 expériences menées sur du matériel de banque de gènes.

Depuis la première publication dans le numéro de la base de données NAR en 2017, le volume de données dans EURISCO n'a cessé d'augmenter :le nombre d'institutions fournisseurs de données est passé de 376 à 402, le nombre d'accessions documentées a augmenté de plus de 200 000 et le nombre de les points de données phénotypiques ont augmenté de 2,2 millions (500 %).

"Cela montre qu'EURISCO est de plus en plus accepté en tant que dépositaire de ces données", déclare Stephan Weise, coordinateur d'EURISCO. "En outre, les données sur les ressources phytogénétiques sont continuellement maintenues et développées par les fournisseurs de données. Chaque année, entre 30 et 40 ensembles de données de l'inventaire national sont mis à jour dans EURISCO, pour une moyenne de 350 000 à 400 000 entrées par an. Avec la Coopérative européenne Program for Plant Genetic Resources (ECPGR), nous organisons des ateliers de formation pour soutenir les fournisseurs de données, et in fine améliorer la qualité des données."

Début 2022, l'interface utilisateur d'EURISCO a été entièrement révisée et comprend une recherche combinée via des données de passeport et phénotypiques, une recherche à facettes, des options de sélection cartographique des accessions ainsi que des indices de recherche pour les noms scientifiques et les noms communs de cultures.

En 2023, EURISCO procédera également à une extension pour inclure des données sur les populations sauvages apparentées aux cultures in situ, qui sont une ressource clé pour les programmes d'amélioration des cultures.

"EURISCO est une pierre angulaire du système européen d'information sur les ressources phytogénétiques, et son développement et son renforcement sont des objectifs clés de la stratégie sur les ressources phytogénétiques pour l'Europe", a conclu Lorenzo Maggioni, secrétaire de l'ECPGR. + Explorer plus loin

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