Chercheurs de l'Université de technologie Chalmers et de l'Université de Göteborg, Suède, ont trouvé plusieurs gènes jusque-là inconnus qui rendent les bactéries résistantes aux antibiotiques de dernier recours. Les gènes ont été trouvés en recherchant de grands volumes d'ADN bactérien et les résultats sont publiés dans la revue scientifique Microbiome .

Le nombre croissant d'infections causées par des bactéries résistantes aux antibiotiques est un problème mondial en croissance rapide. Les bactéries pathogènes deviennent résistantes par des mutations de leur propre ADN ou en acquérant des gènes de résistance d'autres, souvent inoffensif, bactéries.

En analysant de grands volumes de données ADN, les chercheurs ont découvert 76 nouveaux types de gènes de résistance. Plusieurs de ces gènes peuvent fournir aux bactéries la capacité de dégrader les carbapénèmes, notre classe d'antibiotiques la plus puissante utilisée pour traiter les bactéries multirésistantes.

"Notre étude montre qu'il existe de nombreux gènes de résistance inconnus. La connaissance de ces gènes permet de trouver plus efficacement et, espérons-le, de lutter contre de nouvelles formes de bactéries multi-résistantes", dit Erik Kristiansson, Professeur de biostatistique à l'Université de technologie Chalmers et chercheur principal de l'étude.

"Plus nous en savons sur la façon dont les bactéries peuvent se défendre contre les antibiotiques, meilleures sont nos chances de développer efficacement, nouveaux médicaments", explique le co-auteur Joakim Larsson, Professeur de pharmacologie environnementale et directeur du Centre de recherche sur la résistance aux antibiotiques à l'Université de Göteborg.

Les chercheurs ont identifié les nouveaux gènes en analysant des séquences d'ADN de bactéries collectées chez l'homme et dans divers environnements du monde entier.

« Les gènes de résistance sont souvent très rares, et de nombreuses données ADN doivent être examinées avant qu'un nouveau gène puisse être trouvé", dit Kristiansson.

L'identification d'un gène de résistance est également difficile s'il n'a pas été rencontré auparavant. Le groupe de recherche a résolu ce problème en développant de nouvelles méthodes de calcul pour trouver des modèles dans l'ADN associés à la résistance aux antibiotiques. En testant les gènes qu'ils ont identifiés en laboratoire, ils pourraient alors prouver que leurs prédictions étaient correctes.

"Nos méthodes sont très efficaces et peuvent rechercher les modèles spécifiques de nouveaux gènes de résistance dans de grands volumes de données de séquences d'ADN, " dit Fanny Berglund, un doctorant dans le groupe de recherche.

La prochaine étape pour les groupes de recherche consiste à rechercher des gènes qui confèrent une résistance à d'autres formes d'antibiotiques.

« Les nouveaux gènes que nous avons découverts ne sont que la pointe de l'iceberg. Il existe encore de nombreux gènes de résistance aux antibiotiques non identifiés qui pourraient devenir des problèmes de santé mondiaux majeurs à l'avenir. " dit Kristiansson.