Restes squelettiques d'un individu positif pour le VHB du site de l'âge de pierre de Karsdorf, Allemagne. L'individu était un homme avec un âge au décès d'environ 25-30 ans. Crédit :Nicole Nicklisch
Une équipe internationale de scientifiques dirigée par des chercheurs de l'Institut Max Planck pour la science de l'histoire humaine et de l'Université de Kiel a reconstruit avec succès les génomes de souches de l'âge de pierre et de l'Europe médiévale du virus de l'hépatite B. Cette récupération sans précédent de l'ADN d'un virus ancien indique que l'hépatite B circulait en Europe il y a au moins 7000 ans. Alors que l'ancien virus est similaire à ses homologues modernes, les souches représentent une lignée distincte qui s'est probablement éteinte et qui est la plus étroitement liée aux virus des chimpanzés et des gorilles.
Le virus de l'hépatite B (VHB) est l'un des agents pathogènes humains les plus répandus connus aujourd'hui, touchant plus de 250 millions de personnes dans le monde. Cependant, son origine et son histoire évolutive restent floues. L'étude de l'évolution et de l'histoire du virus a été jusqu'à présent particulièrement difficile, car jusqu'à présent, l'ADN viral n'avait pas été récupéré avec succès à partir d'échantillons préhistoriques. Dans la présente étude, qui a été accepté pour publication dans la revue eLife et devrait être publié le 10 mai, 2018, une équipe internationale de chercheurs dirigée par l'Institut Max Planck pour la science de l'histoire humaine et l'Institut de biologie moléculaire clinique de l'Université de Kiel, non seulement récupéré de l'ADN viral ancien à partir de squelettes, mais aussi reconstruit les génomes de trois souches de VHB.
L'histoire ancienne de l'hépatite B
Pour cette étude, les chercheurs ont analysé des échantillons de dents de 53 squelettes excavés de sites néolithiques et médiévaux en Allemagne. Les vestiges datent d'environ 5000 avant JC à 1200 après JC. Les chercheurs ont examiné tous les échantillons à la recherche d'agents pathogènes viraux et ont détecté un ancien VHB chez trois des individus. Les génomes complets du VHB ont été récupérés à partir de ces échantillons, dont deux datent du néolithique, datant d'environ 7000 et 5000 ans, et un de la période médiévale. Les génomes néolithiques représentent les génomes viraux de loin les plus anciens reconstruits à ce jour.
Emplacement géographique des échantillons à partir desquels les anciens génomes du VHB ont été récupérés. Les icônes indiquent le matériau de l'échantillon (dent ou momie). Les génomes du VHB obtenus dans cette étude sont indiqués par un cadre noir. Crédit :Krause-Kyora et al. Les génomes viraux néolithiques et médiévaux révèlent une évolution complexe de l'hépatite B. eLife 2018.
De façon intéressante, les anciens génomes de virus semblent représenter des lignées distinctes qui n'ont pas de proches parents aujourd'hui et qui se sont peut-être éteintes. Les deux génomes néolithiques, bien que récupéré d'individus ayant vécu à 2000 ans d'intervalle, étaient relativement similaires les unes aux autres par rapport aux souches modernes, et étaient en fait plus étroitement liés aux souches modernes de VHB trouvées chez les chimpanzés et les gorilles. En revanche, le génome médiéval du VHB est plus similaire aux souches modernes, mais représente toujours une lignée distincte. C'est le cas même lorsqu'il est comparé à deux génomes du VHB précédemment publiés récupérés sur des momies datant du XVIe siècle. Les souches de VHB trouvées dans ces momies sont étroitement liées aux souches modernes, suggérant un manque surprenant de changement dans le virus au cours des 500 dernières années. Ces résultats indiquent une histoire compliquée pour le virus, qui peut avoir impliqué plusieurs événements de transmission inter-espèces.
Évolution longue et compliquée de l'un des virus les plus courants d'aujourd'hui
"Pris ensemble, nos résultats démontrent que le VHB existait déjà chez les Européens il y a 7000 ans et que sa structure génomique ressemblait étroitement à celle des virus de l'hépatite B modernes, malgré les différences observées, " explique le premier auteur Ben Krause-Kyora, de l'Institut Max Planck des sciences de l'histoire humaine et de l'Université de Kiel. "Des précurseurs plus anciens, les intermédiaires et les souches modernes des souches du VHB humain et non humain doivent être séquencés pour démêler l'évolution complexe de ce virus, " il ajoute.
Restes squelettiques d'un individu séropositif pour le VHB du site médiéval de Petersberg, Allemagne. L'individu était un homme avec un âge au décès d'environ 65-70 ans. Crédit :Ben Krause-Kyora
Johannes Krause, auteur principal et directeur du département d'archéogénétique à l'Institut Max Planck pour la science de l'histoire humaine, souligne l'implication la plus importante de l'étude. "Nos résultats révèlent le grand potentiel de l'ADN ancien de squelettes humains pour nous permettre d'étudier l'évolution des virus véhiculés par le sang. Auparavant, il y avait un doute quant à savoir si nous serions jamais en mesure d'étudier ces maladies directement dans le passé, " explique-t-il. " Nous avons maintenant un outil puissant pour explorer l'histoire évolutive profonde des maladies virales. "
