Le succès des projets de restauration écologique dans le monde pourrait être stimulé grâce à un nouvel outil potentiel qui surveille les microbes du sol.

Publié dans la revue Écologie moléculaire , Des chercheurs de l'Université d'Adélaïde ont montré comment la communauté de bactéries présente dans le sol de terres défrichées et pâturées pendant 100 ans a été ramenée à son état naturel huit ans seulement après la revégétalisation avec des plantes indigènes.

Les chercheurs ont utilisé le séquençage de nouvelle génération de l'ADN dans le sol à partir d'échantillons prélevés sur le site qui avaient une gamme de plantations âgées de six à 10 ans.

La technique - séquençage d'amplicons à haut débit de l'ADN environnemental (eDNA), autrement connu sous le nom de métabarcodage eDNA - identifie et quantifie les différentes espèces de bactéries dans un échantillon.

« La restauration écologique est une intervention de gestion importante utilisée pour lutter contre le déclin de la biodiversité et la dégradation des terres dans le monde, et a des objectifs très ambitieux fixés dans le cadre du Challenge de Bonn et prolongés lors des négociations de Paris sur le climat en 2015, " dit le professeur Andy Lowe, Chaire de biologie de la conservation des plantes à l'Institut de l'environnement de l'Université.

« Le succès de ces objectifs impressionnants dépendra de la mise en œuvre d'interventions de restauration efficaces, mais certains craignent que les résultats escomptés ne soient pas atteints. La plupart des projets sont insuffisamment suivis, le cas échéant, et là où cela se produit, le suivi est exigeant d'un point de vue logistique, difficile à standardiser, et écarte largement la communauté microbienne."

Les chercheurs – étudiants Nick Gellie et Jacob Mills, Le Dr Martin Breed et le professeur Lowe - ont analysé des échantillons de sol sur le site de restauration du réservoir Mt Bold dans les collines d'Adélaïde, Australie du Sud, et les a comparés avec les zones sauvages voisines en tant que « sites de référence ».

« Nous avons montré que la communauté bactérienne d'un ancien champ qui avait été pâturé pendant plus de 100 ans s'était rétablie dans un état similaire à celui de l'habitat naturel suite à la revégétalisation des plantes indigènes - une réussite incroyable, " dit le Dr Breed, Chercheur à l'Institut de l'Environnement.

"Un changement spectaculaire dans la communauté bactérienne a été observé après seulement huit ans de revégétalisation. Les communautés bactériennes dans les sites de restauration plus jeunes étaient plus similaires aux sites défrichés, et les sites plus anciens ressemblaient davantage aux restes de zones boisées. »

Les chercheurs affirment que le méta-codage à barres eDNA est très prometteur en tant que méthode rentable, outil de suivi écologique évolutif et uniforme pour évaluer le succès de la restauration.

« Même s'il a encore besoin d'être développé, cet outil a une portée significative pour améliorer l'efficacité des interventions de restauration plus largement et garantir que les objectifs mondiaux fixés sont atteints, " dit le doctorant Nick Gellie, auteur principal de l'ouvrage.