Carte de contour montrant la récupération totale des N-glycanes marqués du cetuximab sur une plage de températures pour la dénaturation des protéines (60C à 90C) le long de l'axe X et la dé-N-glycosylation (40C à 60C) le long de l'axe Y. Crédit :Corey Reed
Un nouveau rapport de recherche original disponible en avant-première sur Technologie SLAS démontre la semi-automatisation d'un kit GlycoWorks RapiFluor-MS (RFMS) à l'aide d'un robot de pipetage pour améliorer la productivité de la recherche en sciences de la vie. Cette plateforme robotique utilise des pipettes manuelles standards et un bras à guidage optique pour faciliter l'automatisation des procédures manuelles, réduire le temps que les chercheurs passent à la paillasse, et mimer, le plus près possible, les résultats obtenus lors de l'utilisation du protocole manuel GlycoWorks RFMS.
Le kit GlycoWorks RapiFluor-MS (RFMS) a été lancé en 2015 et simplifie la façon dont les chercheurs peuvent libérer et marquer les glycanes liés à l'azote. Le kit permet aux analystes d'effectuer une préparation d'échantillons à haut rendement et garantit des profils de N-glycanes précis et reproductibles. L'étiquette RFMS est unique en ce qu'elle fournit un étiquetage rapide et une sensibilité suprême pour les analyses optiques et spectrométriques de masse.
Auteurs Corey Reed, Jennifer Fournier et Stephan Koza de Waters Corporation (Milford MA) et Nikolas Vamvoukas d'Andrew Alliance simplifient davantage ce protocole de préparation d'échantillons grâce à l'automatisation à l'aide d'une solution robotique disponible dans le commerce d'Andrew Alliance. André, le robot de pipetage, présente une plate-forme idéale pour l'automatisation de ce kit avec sa capacité à pipeter de faibles volumes et à s'adapter à la variabilité des volumes avec des dominos personnalisés spécialement conçus pour cette solution.
Pour reproduire fidèlement les résultats du protocole manuel, les étapes sensibles à la température sont ré-optimisées pour la plate-forme automatisée et une plage de températures est testée pour atteindre une efficacité maximale de libération de N-glycane. Suite à des ajustements mineurs, le protocole automatisé s'avère statistiquement comparable au protocole manuel en termes de récupération des N-glycanes marqués RFMS ainsi que des aires de pics relatifs de fluorescence résultants. En outre, une sous-routine dans la procédure simplifie le processus de normalisation de la concentration de l'échantillon avant le protocole RFMS, un gain de temps considérable pour les utilisateurs.
À la fin, les auteurs adoptent un protocole robuste et facile à utiliser et étendent avec succès les avantages à la recherche en sciences de la vie en augmentant la productivité du laboratoire. Les utilisateurs peuvent désormais passer en toute transparence du protocole manuel à la solution automatisée, soulager les utilisateurs du pipetage monotone et contrôler les zones clés du protocole normalement sujettes aux erreurs de l'utilisateur.