La liaison hydrogène n'est pas un type de liaison ionique. Il s’agit plutôt d’une interaction dipôle-dipôle entre un atome d’hydrogène lié de manière covalente à un atome électronégatif (tel que N, O ou F) et un autre atome électronégatif. L’atome électronégatif attire les électrons de la liaison covalente, créant une charge partielle positive sur l’atome d’hydrogène. Cette charge positive partielle interagit ensuite avec la charge négative partielle de l’autre atome électronégatif, formant une liaison hydrogène.

Contrairement aux liaisons ioniques, formées par le transfert d’électrons d’un atome à un autre, les liaisons hydrogène sont formées par l’attraction électrostatique entre des charges partielles. Les liaisons hydrogène sont plus faibles que les liaisons ioniques, mais elles jouent néanmoins un rôle important dans la structure et la fonction des molécules et des matériaux. Par exemple, les liaisons hydrogène sont responsables du point d’ébullition élevé de l’eau, de la structure des protéines et de l’appariement des bases de l’ADN.