Les chaînes protéiques se replient généralement pour fonctionner. Le repliement est un processus complexe et s'il est effectué correctement, il conduit à une topologie de repliement fonctionnelle unique pour une chaîne protéique donnée. D'autres topologies sont également possibles mais sont souvent non fonctionnelles ou toxiques. Ces protéines mal repliées sont ensuite dépliées et ensuite repliées à la topologie de repli correcte; autrement, ils subissent une dégradation.

Plusieurs machines dont ClpB et ClpG sont responsables du dépliage d'une protéine repliée. ClpB travaille en étroite collaboration avec HSP70 (DnaK) et HSP40 (DnaJ) et utilise de l'énergie pour dérouler une chaîne tandis que ClpG ne dépend pas de HSP70. Une question majeure est de savoir pourquoi les cellules sont équipées de différents types de machines et qu'est-ce qui détermine l'efficacité du dépliage. Alireza Mashaghi et son équipe du LACDR/Université de Leiden ont résolu cette énigme en surveillant le déroulement de modèles de chaîne mal repliés au niveau d'une seule molécule. Trois approches de déroulement ont été comparées, à savoir, se faufiler dans un pore, tirant des extrémités, et tirant par enfilage.

Les résultats de cette analyse, qui sont publiés le 25 octobre dans le Journal de chimie physique B , révèlent que la topologie du circuit de la chaîne pliée détermine de manière critique le nombre de voies et l'efficacité du déploiement d'une manière qui dépend de l'approche mécanique employée. L'étude fournit des informations sur les mécanismes de déploiement des protéines cellulaires. Ces résultats peuvent aider à sélectionner des cibles chaperon optimales pour la pharmacothérapie des maladies mal repliées.