Les tests d'amplification nucléaire sont couramment utilisés pour la détection d'agents pathogènes; cependant, le processus est actuellement manuel intensif et complexe, et nécessite un équipement dédié. Cela empêche son utilisation dans certains paramètres, et la détection d'agents pathogènes dans des échantillons individuels.
Afin de résoudre ces problèmes, Natalia Sandetskaya et ses collègues du Fraunhofer Institute for Cell Therapy &Immunology (Leipzig, Allemagne) ont développé un prototype de plate-forme de laboratoire sur puce capable d'automatiser le processus dans un seul instrument.
"Nous avons été motivés par le besoin existant de rendre l'analyse moléculaire d'échantillons complexes beaucoup plus simple pour les utilisateurs, " a commenté Sandetskaya. " Notre intérêt appliqué particulier est la détection des agents pathogènes dans le sang; par exemple dans le sepsis, alors que seuls quelques micro-organismes doivent être rapidement trouvés dans un grand volume de sang."
La puce utilise la microfluidique et intègre une transition de volume d'échantillon, lyse, isolement d'acide nucléique, amplification (PCR ou LAMP), et détection de fluorescence en temps réel. En tant qu'instrument unique, il pourrait permettre des diagnostics dans des situations qui n'étaient pas réalisables auparavant.
Les chercheurs continuent à démontrer sa preuve de concept dans la détection de E. coli et Salmonelle espèces bactériennes.
« Bien que notre prototype actuel de la plate-forme nécessite un développement supplémentaire pour cette application, nous avons déjà démontré un haut niveau d'intégration de processus très divers sans complexifier excessivement le système, " a noté Sandetskaya.
L'équipe planifie maintenant des expériences pour évaluer la plate-forme dans des échantillons du monde réel et perfectionner sa conception.
L'article complet "Une plate-forme de laboratoire sur puce polyvalente intégrée pour l'isolement et la détection à base d'acide nucléique des agents pathogènes" est disponible en libre accès sur Science du futur OA .