Cependant, il est important de noter que la classification des organismes en royaumes est un système quelque peu dépassé. Les systèmes de classification modernes, comme le système à trois domaines, ont remplacé le système traditionnel à cinq rois. Dans le système à trois domaines, les procaryotes sont divisés en deux domaines: bactéries et archaea .
Ainsi, alors que "Monera" est encore parfois utilisé pour désigner les procaryotes, il est plus précis de dire que les procaryotes appartiennent aux bactéries et aux archées des domaines.
