Il a observé de fines tranches de liège au microscope en 1665 et a remarqué de petits compartiments en forme de boîte qui lui rappelaient les cellules que les moines vivaient. Il a décrit ces compartiments comme des "cellules" dans son livre * Micrographia *.
Alors que Hooke observait les parois cellulaires vides des cellules végétales mortes, son travail a jeté les bases de la compréhension des cellules comme les unités fondamentales de la vie.