Bactéries anaérobies n'ont pas besoin d'oxygène pour vivre. Ils peuvent générer de l’énergie par fermentation ou respiration anaérobie, qui ne nécessitent pas d’oxygène comme accepteur final d’électrons. Les bactéries anaérobies se trouvent dans une grande variété d’habitats, notamment le sol, l’eau et le corps humain. Quelques exemples courants de bactéries anaérobies comprennent *Clostridium botulinum* (qui provoque le botulisme), *Escherichia coli* (qui peut provoquer une intoxication alimentaire) et *Staphylococcus aureus* (qui peut provoquer des infections cutanées).