1. Méthylation de l'ADN : Il s’agit du mécanisme le plus courant par lequel les bactéries font la distinction entre leur propre ADN et l’ADN étranger. La méthylation implique l'ajout d'un groupe méthyle à des bases spécifiques de l'ADN, telles que l'adénine ou la cytosine. Cette modification peut altérer la structure de l'ADN et le rendre moins sensible à la digestion par les enzymes de restriction, qui sont des enzymes qui coupent l'ADN au niveau de séquences spécifiques. Les bactéries possèdent généralement des enzymes qui méthylent leur propre ADN à des sites spécifiques, et elles peuvent reconnaître et distinguer l'ADN méthylé et non méthylé.
2. Systèmes de modification des restrictions : Ces systèmes impliquent l'utilisation de deux types d'enzymes :les enzymes de restriction et les enzymes de modification. Les enzymes de restriction reconnaissent et coupent l'ADN à des séquences spécifiques, tandis que les enzymes de modification modifient l'ADN pour le protéger de la digestion par les enzymes de restriction. Les bactéries ont généralement leurs propres systèmes de modification de restriction spécifiques, et elles peuvent reconnaître et distinguer l'ADN qui a été modifié par leurs propres enzymes de modification et l'ADN qui ne l'a pas été.
3. Reconnaissance de séquences d'ADN : Certaines bactéries peuvent également reconnaître leur propre ADN en reconnaissant simplement les séquences spécifiques de nucléotides présentes dans l'ADN. Cela peut être réalisé par des protéines qui se lient à des séquences d'ADN spécifiques, telles que des facteurs de transcription ou des protéines régulatrices. Ces protéines peuvent alors déclencher l'expression de gènes ou d'autres processus cellulaires spécifiques à la reconnaissance de l'ADN propre de la bactérie.
4. Conformation chromosomique : Les bactéries peuvent également reconnaître leur propre ADN en fonction de sa conformation ou de sa structure globale. Cela peut être réalisé par des protéines qui se lient à des structures spécifiques de l'ADN, telles que les histones ou les condensines. Ces protéines peuvent aider à maintenir la structure appropriée de l’ADN et à empêcher sa dégradation ou sa réorganisation.
Ces mécanismes permettent aux bactéries de faire la distinction entre leur propre ADN et l’ADN étranger, ce qui est important pour se protéger du matériel génétique étranger potentiellement nocif.