Selon David Orton, professeur d'archéologie à l'Université de York et chercheur principal du projet, « les marais étaient clairement leur pâturage préféré. Même une dépendance partielle à l’égard des ressources en eau douce, comme cela s’est produit à l’âge du bronze, a eu des conséquences évidentes à long terme sur le fardeau des maladies parasitaires humaines. "Ce n'était pas nécessairement un composant diététique désagréable à l'époque", explique Andrew West, conservateur adjoint de la bioarchéologie aux musées nationaux d'histoire naturelle du Smithsonian, membre de l'équipe de fouilles de Flag Fen. « C’étaient des adultes en bonne santé. Ils n’auraient certainement pas la diarrhée. Mais sur 30 ans, 40 ans, 50 ans, ça leur a apporté quoi » ?
Orton a trouvé des traces de trichocéphales. trichures et vers ronds en plus des amibes parasites. Tous sont associés à une contamination fécale humaine ou à l’ingestion d’eau de marais non traitée contenant des kystes et des œufs parasitaires.