Pendant la saison de reproduction, les macareux moines plongent la tête la première dans l’eau pour attraper des poissons et autres proies. Mais en dehors de la saison de reproduction, les macareux ont tendance à se nourrir en vol. Ils volent au-dessus de l'eau et utilisent leur bec pour effleurer la surface, attrapant de petits poissons et autres créatures aquatiques. Les macareux moines peuvent également attraper des insectes volants, tels que des mouches et des moucherons, dans les airs.