Une nouvelle étude menée par des chercheurs de l'Université Duke a mis en lumière la façon dont les virus infectant les bactéries intestinales changent et se reproduisent au fil du temps, un processus connu sous le nom d'« évolution intra-hôte ». Les résultats contribuent à notre compréhension de la relation dynamique et complexe entre virus et bactéries dans le contexte du microbiome intestinal.

À l’intérieur de notre tube digestif, nous hébergeons des milliards de micro-organismes, notamment des bactéries, des virus et des champignons, collectivement appelés microbiote intestinal. Les bactéries intestinales jouent un rôle crucial dans la digestion, l’absorption des nutriments, le développement du système immunitaire et la santé globale. Cependant, ces bactéries sont constamment attaquées par des virus qui peuvent les infecter et perturber leurs fonctions.

Les chercheurs de la présente étude se sont concentrés sur un groupe spécifique de virus qui infectent une bactérie intestinale courante appelée Bacteroides. Grâce à une technologie de séquençage de pointe, ils ont suivi la façon dont ces virus se sont répliqués et modifiés au sein de chaque hôte au fil du temps. L’équipe a collecté des échantillons de selles auprès de quatre sujets humains à plusieurs reprises au cours de plusieurs semaines.

Principales conclusions :

Evolution virale rapide :L’étude a révélé que les virus intestinaux infectant les Bacteroides ont subi une évolution rapide au sein de chaque hôte. Les génomes viraux ont accumulé de nombreuses mutations et modifications génétiques sur une période de temps relativement courte.

Compétition virale et adaptation :Les résultats suggèrent que la population virale présente dans l’intestin est hautement compétitive. Les virus capables de se répliquer et de s’adapter plus efficacement présentaient un avantage sélectif et devenaient plus abondants au fil du temps. Cet environnement compétitif a conduit à l’évolution virale rapide observée dans l’étude.

Divers génomes viraux :Les chercheurs ont découvert que les populations virales au sein de chaque hôte individuel étaient très diverses. Cette diversité résulte probablement de l’afflux constant de nouveaux virus, de la réplication virale et de la compétition au sein de l’écosystème intestinal.

Implications potentielles pour la santé intestinale :Les résultats ont des implications potentielles sur la santé et les maladies intestinales. Il est possible que l’évolution et l’adaptation des virus intestinaux influencent le comportement et le fonctionnement de leurs hôtes bactériens, contribuant ainsi au développement de troubles liés à l’intestin tels que les maladies inflammatoires de l’intestin ou certains types de cancer.

Bien que cette étude fournisse des informations précieuses sur l’évolution intra-hôte des virus dans les bactéries intestinales, des recherches supplémentaires sont nécessaires pour comprendre de manière globale les conséquences à long terme et les implications plus larges de ces changements viraux sur la santé humaine. De plus, l’étude des interactions entre virus et bactéries dans le microbiome intestinal pourrait conduire au développement de nouvelles approches thérapeutiques pour moduler le microbiote intestinal afin d’améliorer les résultats pour la santé.