C'est l'une des conclusions d'une étude menée par des chercheurs de l'Université de São Paulo (USP) au Brésil et de l'Université d'État de Pennsylvanie aux États-Unis. Selon les chercheurs, il s'agissait de la première étude jamais réalisée pour caractériser la composition microbienne du liquide buccal, des selles et de l'environnement des porcelets en pouponnière dans des fermes commerciales au Brésil.

Un article sur l'étude est publié dans Scientific Reports. . Les résultats contribueront à l'identification de marqueurs de santé gastro-intestinale chez ces animaux, qui produisent près de 5 millions de tonnes de viande par an au Brésil.

La cavité buccale est la porte d’entrée dans l’organisme de nombreuses bactéries qui affectent la santé de la plupart des animaux, mais elle peut également apporter une solution au problème. Chez l'humain par exemple, le microbiote local (l'ensemble des micro-organismes présents dans l'environnement et vivant en relation symbiotique avec l'hôte) est connu pour offrir une protection contre les micro-organismes extérieurs.

La littérature scientifique contient peu d'études sur la composition bactérienne de la cavité buccale du porc, en particulier sur la salive, un mélange de salive et de transsudat muqueux (liquide dérivé du transport passif des composants du sérum à travers la muqueuse buccale jusqu'à la bouche). C'était l'objet de l'étude en question.

Les auteurs ont analysé le liquide buccal de 50 porcelets sevrés vivant dans cinq grandes et petites fermes commerciales de l'État de São Paulo. Le choix des animaux dans cette tranche d’âge n’était pas aléatoire. Le sevrage est une période très stressante pour les porcelets en raison de la séparation de la truie et du passage à une alimentation solide, ce qui modifie le microbiote et peut voir l'émergence de plusieurs maladies.

Les compositions bactériennes des échantillons oraux, fécaux et du sol des enclos ont été déterminées par séquençage du gène de l'ARNr 16S et analysées à l'aide du logiciel statistique R Studio. Les résultats ont montré que la plupart des bactéries du liquide buccal appartenaient aux phyla Firmicutes (80,4 %) et Protéobactéries (7,7 %). Les Streptococcus (Pasteurellaceae) et Veillonella étaient particulièrement abondants dans la salive par rapport aux échantillons fécaux, dans lesquels Streptococcus était un genre principal fortement corrélé avec d'autres taxons, bien qu'il y ait une forte variabilité entre les fermes.

Des échantillons fécaux et environnementaux (sol du stylo) ont également été analysés pour déterminer la composition du microbiote. "Il s'agit d'une étape importante car l'environnement dans lequel les porcs sont élevés est la principale source de bactéries dans leur cavité buccale, et toute différence dans les bactéries entrant et sortant de l'organisme se retrouve dans les selles", a déclaré Vera Letticie de Azevedo Ruiz, dernière auteur de l'article et professeur de médecine vétérinaire à l'École des sciences animales et de l'ingénierie alimentaire de l'Université de São Paulo (FZEA-USP).

Les phylums les plus abondants dans ces échantillons étaient Firmicutes, Proteobacteria et Bacteroidota, et le genre le plus courant était Prevotella_9. Contrairement à la salive, leur composition était similaire quelle que soit la taille de l'exploitation et les procédures de nettoyage.

"De plus, la diversité alpha [le nombre d'espèces dans les échantillons individuels] variait considérablement selon les types d'échantillons. Elle était plus faible dans les échantillons de salive que dans les échantillons de matières fécales et de sols d'enclos", a déclaré Vinicius Buiatte, premier auteur de l'étude et chercheur au Département des sciences animales de Penn State.

"Dans le cas de la diversité bêta [variabilité de la composition et de la richesse en espèces d'un échantillon à l'autre], les communautés présentes dans les échantillons fécaux étaient plus proches de celles des échantillons environnementaux et plus éloignées de celles des échantillons oraux."

Bénéfices pour la santé et la production

Selon les chercheurs, une compréhension plus approfondie du microbiote du liquide buccal sert de base à la recherche sur les microbiomes et à l'amélioration de la santé et de la production porcine.

"Si vous savez quels micro-organismes sont les plus courants dans un endroit donné, vous pouvez par exemple étudier des marqueurs de la santé bucco-dentaire ou des bactéries liées à des maladies telles que des infections des voies gastro-intestinales et respiratoires, et même des troubles du système nerveux central", a déclaré Buaitte.

Les résultats de l’étude peuvent également créer des opportunités pour le développement de solutions visant à améliorer la santé des porcs et la production porcine. "C'est le cas, par exemple, des prébiotiques qui facilitent la multiplication et l'installation de bactéries bénéfiques", a-t-il expliqué.

Les prochaines étapes pour les chercheurs comprennent l’étude des changements dans le microbiome intestinal, car il a été constaté que les bactéries de la cavité buccale diffèrent des bactéries fécales. Cela implique l'analyse, actuellement en cours, de cinq segments intestinaux distincts chez 40 porcelets.