Pour commémorer les 25 ans du Wellcome Trust Sanger Institute en 2018, l'Institut et ses collaborateurs séquencent 25 nouveaux génomes d'espèces au Royaume-Uni. Les cinq dernières espèces ont maintenant été choisies par des milliers d'écoliers et de membres du public du monde entier, qui ont participé au vote en ligne du 25 Genomes Project.
Le projet pourrait révéler pourquoi certaines truites brunes migrent vers l'océan ouvert, tandis que d'autres non, ou nous en dire plus sur les récepteurs magnéto dans les yeux des rouges-gorges qui leur permettent de « voir » les champs magnétiques de la Terre. Cela pourrait également expliquer pourquoi les écureuils roux sont vulnérables au virus de la variole de l'écureuil, pourtant, les écureuils gris peuvent être porteurs et propager le virus sans tomber malades.
Tous les résultats seront rendus publics et conduiront à de futures études pour comprendre la biodiversité du Royaume-Uni et aider à la conservation et à la compréhension de ces espèces.
Le Sanger Institute a été fondé en 1993 par le professeur Sir John Sulston dans le cadre du Human Genome Project. L'Institut a apporté la plus grande contribution à la séquence de référence du premier génome humain, qui a été publié en 2003.
Un génome est l'ensemble complet d'instructions génétiques d'un organisme écrites dans l'ADN. Chaque génome contient toutes les informations nécessaires pour construire cet organisme et lui permettre de grandir et de se développer.
Depuis l'achèvement historique du génome humain, l'Institut Sanger est devenu un leader mondialement reconnu dans le domaine de la génomique. De nombreux génomes de référence plus importants ont déjà été séquencés - des génomes de la souris et du poisson zèbre au porc, gorille, moustique et bien d'autres. Au-delà des espèces animales, les maladies infectieuses et les bactéries figurent également en bonne place sur la liste des génomes de référence, de la salmonelle et du SARM à la chlamydia et au paludisme. Tous ces éléments ont offert des informations importantes sur la santé et la maladie de ces espèces.
Maintenant, le Sanger Institute et ses partenaires procèdent au séquençage complet de 25 espèces du Royaume-Uni. Ce projet est une petite contribution à une entreprise beaucoup plus vaste, où des scientifiques du monde entier se réunissent pour former un plan pour séquencer toute la vie sur Terre.
Ce projet a été rendu possible grâce à la technologie de séquençage longue lecture PacBio®, qui génère des génomes de haute qualité. L'Institut travaille en partenariat avec PacBio et d'autres leaders du secteur technologique, 10x Génomique et Illumina, pour créer la vue la plus complète de ces génomes.
Les génomes de haute qualité ouvriront des portes aux scientifiques pour utiliser ces informations, et les chercheurs pourraient découvrir comment les espèces britanniques réagissent aux pressions environnementales, et quels secrets ils détiennent dans leur génétique qui leur permet de s'épanouir, ou plie.
Les 25 espèces sont réparties en cinq catégories selon les qualités qu'elles partagent :espèces en hausse au Royaume-Uni; Flottant, espèces menacées et en déclin; Dangereux, espèces envahissantes et nuisibles; Iconique, des espèces typiquement britanniques que nous reconnaissons tous; Cryptique, espèces qui sont hors de vue ou impossibles à distinguer des autres sur la seule base de l'apparence.
Les 25 espèces dont le génome sera séquencé sont :
Espèces florissantes :
Espèce de plie :
Espèces dangereuses :
Espèce emblématique :
Espèces cryptiques :
Cinq espèces choisies par le public :
Professeur Sir Mike Stratton, Directeur du Wellcome Trust Sanger Institute, a déclaré : « Il y a vingt-cinq ans, le domaine de la génomique était une idée naissante et ses implications ne faisaient que rêver. Aujourd'hui, la réalité de la génomique et des biodonnées est qu'elle transforme notre compréhension, diagnostic, et le traitement des maladies, allant du cancer et des maladies cardiaques au paludisme et aux infections. La science et la technologie qui animent cette ère de découverte accélèrent notre compréhension du corps humain, mais aussi du monde qui nous entoure.
Ce projet est venu après de nombreuses conversations réfléchies à travers le monde concernant le nombre d'espèces de notre planète qui pourraient être séquencées au cours des prochaines décennies - en principe, tous. Nous entamons notre contribution au séquençage de toute vie sur Terre. »
Dr Julia Wilson, Directeur associé du Wellcome Trust Sanger Institute, a déclaré :« Grâce au séquençage de ces 25 génomes, les scientifiques acquerront une meilleure compréhension des espèces britanniques, comment ils sont arrivés ici, leur évolution, et comment différentes espèces s'adaptent à un environnement changeant. Les résultats pourraient révéler des vérités cachées chez ces espèces, et permettra à la communauté scientifique de comprendre comment notre monde change et évolue constamment autour de nous. Nous voulons célébrer le 25e anniversaire de l'Institut Sanger d'une manière spéciale « Sanger », et je suis ravi de voir comment se déroule le 25 Genomes Project."
Ken Skeldon, Responsable de l'engagement du public au Wellcome Genome Campus, a déclaré :« Donner au public la possibilité de choisir les espèces dont le génome est séquencé dans le projet 25 génomes a apporté de nouvelles perspectives au projet. Nous sommes ravis de voir que tant de personnes et d'écoliers à travers le Royaume-Uni et au-delà se sont activement engagés dans des discussions en ligne avec les scientifiques et ont voté pour les cinq dernières espèces."
Tim Littlewood, Le directeur des sciences de la vie du Natural History Museum a déclaré :« Le Natural History Museum est fier de collaborer avec le Sanger Institute pour célébrer son 25e anniversaire et également pour célébrer les avancées que les techniques moléculaires telles que le séquençage du génome peuvent apporter à l'étude du Royaume-Uni. Les 80 millions de spécimens dont nous nous occupons, du monde entier, détenir une mine d'informations génétiques qui nous permet de mener des recherches innovantes, relever les défis mondiaux. Un accent sur la biodiversité britannique avec une technologie de pointe est particulièrement bienvenu. »
