A première vue, la levure Candida krusei semble aussi inoffensive que les microbes viennent :elle est utilisée pour la fermentation des fèves de cacao et donne au chocolat son arôme agréable. Mais on le trouve de plus en plus comme agent pathogène chez les patients immunodéprimés et les infections à C. krusei ne sont pas toujours faciles à guérir. Cette levure est naturellement résistante au fluconazole, un antifongique de première intention essentiel non seulement pour traiter de nombreuses infections fongiques, mais aussi pour les prévenir dans les populations sensibles. Dans le numéro de septembre de G3 , Cuomo et al. dévoiler la première séquence du génome entier d'un échantillon clinique de C. krusei, fournissant des pistes sur des gènes qui peuvent être importants pour la résistance de l'espèce au fluconazole.

Certains projets d'assemblages du génome de C. krusei avaient été produits avant les travaux de ces chercheurs, mais ils étaient fragmentés, un problème causé par une grande quantité d'hétérozygotie. La clé de leur succès était de générer de longues lectures de séquençage, produisant un assemblage avec pas beaucoup plus d'échafaudages que C. krusei n'a de chromosomes.

Avec leur nouveau brouillon en main, Brand et al. a cherché dans le C. kruseigenome des gènes associés à la pathogenèse chez le Candida albicans plus familier - la cause du muguet, mycoses vaginales, et parfois des infections systémiques potentiellement mortelles. C. krusei, ils ont trouvé, a peu de copies de familles de gènes associées à la pathogenèse chez C. albicans, y compris les transporteurs d'oligopeptides, aspartyle protéases, et les gènes de la phospholipase B. Les espèces de Candida qui causent souvent des maladies ont généralement des expansions dans ces familles de gènes, donc étant donné que C. krusei est rarement pathogène, ce constat est logique.

Lorsqu'ils se sont concentrés sur les gènes impliqués dans la résistance aux médicaments, le groupe a découvert que C. krusei diffère de C. albicans; bon nombre des sites qui sont souvent mutés dans la cible des médicaments azolés chez C. albicans résistant ne sont pas mutés chez C. krusei. Cela implique que la résistance naturelle de la levure de fermentation du cacao au fluconazole provient d'un mécanisme différent de celui qui permet généralement à C. albicans de résister aux médicaments azolés.

Les chercheurs n'ont pas non plus trouvé le gène MDR1, qui code pour un transporteur de médicament souvent responsable de la résistance à plusieurs médicaments. Ils l'ont fait, cependant, trouver des copies de gènes liés à CDR1, CDR2, et quelques autres qui codent pour d'autres transporteurs associés à la résistance aux médicaments, bien que leur fonctionnement chez C. krusei soit inconnu. Ces gènes pourraient être un point de départ pour découvrir les mécanismes de la résistance aux antifongiques chez C. krusei, potentiellement conduire à de meilleurs traitements et mesures préventives pour les populations très vulnérables.