Durian (intact et ouvert). Crédit :Kevin Lim, Yong Chern Han, Cédric Ng
Des scientifiques singapouriens et des collaborateurs internationaux ont réalisé une première mondiale en déchiffrant la carte génétique complète du durian, une délicatesse de fruits tropicaux prisée connue en Asie comme le "roi des fruits". Les efforts de l'équipe de Singapour ont été motivés à la fois par une curiosité scientifique innée et un amour du fruit.
"Être généticien, J'étais naturellement curieux au sujet du génome durian - quel gène provoque son odeur piquante ? Comment son enveloppe épineuse est-elle apparue ?", a déclaré le co-auteur de l'étude, le professeur Teh Bin Tean, un amoureux du durian et actuellement directeur adjoint du National Cancer Center de Singapour.
Grâce à des plateformes de séquençage à la pointe de la technologie, l'équipe a cartographié le génome d'une variété particulière de durian appelée Musang King ("Mao Shan Wang" en chinois), connu pour sa texture exceptionnellement délicate et son arôme puissant et considéré comme le roi des rois dans le monde du durian local. L'analyse de l'équipe a révélé que le génome du durian comprend environ 46, 000 gènes, soit presque le double de celui des humains, qui ont environ 23 ans, 000 gènes. Sur la base des données génomiques nouvellement générées, l'équipe a également étudié l'évolution du durian et a retracé sa relation de 65 millions d'années à la plante de cacao, qui produit du chocolat.
L'équipe s'est également concentrée sur la question à un million de dollars :qu'est-ce qui cause l'odeur notoire du durian ? En comparant les modèles d'activité des gènes de différentes parties de la plante durian, y compris les feuilles, racines et fruits mûrs, ils ont identifié une classe de gènes appelés MGL (méthionine gamma lyases) qui régulent la production de composés odorants appelés composés soufrés volatils (VSC).
"Notre analyse a révélé que la production de VSC est turbocompressée dans les fruits durian, ce qui correspond à l'opinion de nombreuses personnes selon laquelle l'odeur du durian a un aspect "soufre", " a déclaré le co-auteur principal, le professeur Patrick Tan de la Duke-NUS Medical School. L'équipe spécule que dans la nature, la capacité des durians à produire des niveaux élevés de VSC et une odeur piquante peut être importante pour attirer les animaux à manger et à disperser les graines de durian dans d'autres régions.
L'expertise technologique développée par l'équipe peut également être appliquée à d'autres usines, y compris ceux qui peuvent avoir une valeur médicinale. Professeur Soo Khee Chee, directeur du National Cancer Center de Singapour, mentionné, « Il existe une longue et remarquable histoire de découverte de médicaments à partir de plantes. Le meilleur exemple est le Taxol, le médicament bien connu utilisé pour traiter le cancer du sein, et il est à l'origine dérivé de l'écorce de l'if du Pacifique."
L'équipe note qu'outre l'espèce spécifique de durian (Durio zibethenus) séquencée dans cette étude, il existe plus de 25 autres espèces de durians dans la nature; certains sont comestibles et d'autres non.
"Beaucoup de ces autres espèces de durians se trouvent dans cette partie du monde, et malheureusement, certains sont menacés en raison de la perte croissante de biodiversité. Le séquençage de l'ADN est donc un outil important pour protéger les précieuses informations contenues dans ces plantes fascinantes et importantes, " a déclaré le professeur Teh.
Publié dans la revue Génétique de la nature , l'équipe a fait don des données du génome du durian au National Parks Board, où ils espèrent que cela stimulera la recherche et l'enseignement du durian à Singapour et dans la région. L'équipe a également hâte de travailler avec les botanistes du National Parks Board pour étudier d'autres plantes, en particulier ceux qui sont menacés dans la région en raison de la déforestation et de l'industrialisation croissantes.