Deux coupes virtuelles à angle droit à travers le système nerveux complet d'une larve de mouche des fruits. La combinaison de la microscopie à expansion, La microscopie à nappe de lumière et le traitement des données permettent aujourd'hui de reconstituer optiquement cet organe complexe avec une résolution nanométrique. Ces données ont le potentiel de suivre les cellules nerveuses individuelles sans microscopie électronique complexe et ainsi d'accélérer considérablement les études pour étudier la fonction neuronale. Chaque section surlignée en couleur est une grande image 3D qui a été automatiquement assemblée comme une mosaïque en une image globale de plusieurs centaines de gigaoctets. Crédit :Janelia / MDC
Les techniques modernes de microscopie optique fournissent des informations extrêmement détaillées sur les organes, mais les téraoctets de données qu'ils produisent sont généralement presque impossibles à traiter. Nouveau logiciel, développé par une équipe dirigée par le scientifique du MDC Dr. Stephan Preibisch et maintenant présenté dans Méthodes naturelles , aide les chercheurs à donner un sens à ces masses de données.
Cela fonctionne presque comme une baguette magique. A l'aide de quelques trucs et ruses chimiques, Depuis quelques années, les scientifiques sont capables de rendre transparentes de grandes structures comme des cerveaux de souris et des organoïdes humains. CLARITY est peut-être la plus connue des nombreuses techniques de compensation d'échantillons, avec lequel presque n'importe quel objet d'étude peut être rendu presque aussi transparent que l'eau. Cela permet aux chercheurs d'étudier les structures cellulaires d'une manière dont ils ne pouvaient que rêver auparavant.
Et ce n'est pas tout. En 2015, un autre tour de magie, appelé microscopie à expansion, a été présenté dans la revue Science . Une équipe de recherche du Massachusetts Institute of Technology (MIT) à Cambridge a découvert qu'il était possible d'étendre des tranches ultrafines de cerveaux de souris près de cinq fois leur volume d'origine, permettant ainsi d'examiner les échantillons de manière encore plus détaillée.
Le logiciel donne des ordres au chaos des données
"A l'aide de microscopes modernes à nappe de lumière, que l'on trouve maintenant dans de nombreux laboratoires, les grands échantillons traités par ces méthodes peuvent être rapidement imagés, " dit le Dr Stephan Preibisch, chef du groupe de recherche sur la microscopie, Analyse d'images et modélisation d'organismes en développement à l'Institut berlinois de MDC pour la biologie des systèmes médicaux (BIMSB). "Le problème, cependant, est que la procédure génère de telles quantités de données - plusieurs téraoctets - que les chercheurs ont souvent du mal à passer au crible et à organiser les données. »
