Rendu d'une simulation de tumeur tissulaire en vrac. Crédit :Springer
La vascularisation tumorale est une cible majeure des thérapies anticancéreuses. Rieger, Fredrich et Welter à l'Université de la Sarre, L'Allemagne poursuit depuis plusieurs années une analyse quantitative des déterminants physiques des tumeurs vascularisées. À l'aide de simulations informatiques, ils ont pu récapituler les connaissances acquises grâce à la recherche in vitro des sphéroïdes tumoraux, des modèles animaux et des études cliniques et ont recréé un système tumoral vascularisé in silico.
Ils ont récemment publié le tumorcode, un logiciel qui assemble plusieurs modèles connus dans une approche multi-échelle qui permet de décrire la croissance tumorale à des échelles de longueur pertinentes pour les applications cliniques. Le code et un manuel d'utilisation détaillé sont ouverts et accessibles au public, dans l'espoir que d'autres utilisations et améliorations accéléreront les progrès et les découvertes dans le domaine.
Dans ce EPJE Dans l'article Trucs et astuces, les auteurs présentent les aspects techniques suivant le déroulement d'une procédure de simulation typique. Surtout, leur approche permet l'étude des aspects topologiques et fonctionnels en même temps, ce qui est pertinent pour les traitements thérapeutiques.
Le code source tumorcode est disponible sous licence open source sur :https://github.com/thierry3000/tumorcode