La liaison intermoléculaire du méthanol est la liaison hydrogène. La liaison hydrogène est une interaction dipôle-dipôle qui se produit entre un atome d'hydrogène lié à un atome hautement électronégatif (tel que l'oxygène, l'azote ou le fluor) et un autre atome électronégatif. Dans le cas du méthanol, l’atome d’hydrogène du groupe hydroxyle est lié à l’atome d’oxygène hautement électronégatif, ce qui crée une charge partielle positive sur l’atome d’hydrogène. Cette charge positive partielle peut alors interagir avec la charge négative partielle d’un autre atome d’oxygène dans une molécule de méthanol proche, formant une liaison hydrogène.