Voici une ventilation de ce qui fait un phylotype:
* basé sur les séquences d'ADN: Les phylotypes sont définis par les séquences uniques d'un gène ou d'une région génétique spécifique, généralement avec un seuil spécifique pour la façon dont les séquences doivent être similaires pour être considérées comme le même phylotype.
* pas nécessairement une espèce: Un phylotype peut correspondre à une espèce connue, mais elle peut également représenter un groupe d'organismes étroitement apparentés qui n'ont pas été officiellement classés comme espèce.
* utile pour étudier les communautés microbiennes: Les phylotypes sont particulièrement importants pour étudier les communautés microbiennes, où les méthodes taxonomiques traditionnelles sont souvent difficiles ou impossibles à appliquer en raison de la grande diversité des micro-organismes.
Voici quelques points clés sur les phylotypes:
* Ce sont des unités taxonomiques opérationnelles (OTUS): Les phylotypes sont souvent utilisés de manière interchangeable avec le terme «unité taxonomique opérationnelle» (OTU), qui fait référence à tout groupe d'organismes considérés comme une unité distincte pour l'analyse.
* ils peuvent être définis à différents niveaux taxonomiques: Un phylotype peut représenter une espèce, un genre ou un groupe taxonomique plus spécifique, selon le gène choisi et le seuil de similitude de séquence.
* Ils sont dynamiques: Les définitions de phylotypes peuvent être révisées à mesure que davantage de données de séquence deviennent disponibles et notre compréhension de la diversité microbienne évolue.
en résumé: Les phylotypes sont un outil puissant pour comprendre la diversité et l'évolution microbiennes. Ils permettent aux chercheurs de regrouper les organismes en fonction de leurs relations génétiques, même lorsque les méthodes taxonomiques traditionnelles ne sont pas réalisables. Ceci est particulièrement important dans l'étude des communautés microbiennes, où l'identification et la classification des espèces individuelles peuvent être un défi.
