Un cadre de lecture ouvert (ORF) est une séquence d'ADN ou d'ARN qui peut être traduite en protéine. Il est caractérisé par:

1. Démarrer le codon: Un ORF commence par un codon de démarrage, généralement août (méthionine).

2. Stop Codon: Un ORF se termine par un codon d'arrêt, généralement UAA, UAG ou UGA.

3. Séquence de codage continu: La séquence entre les codons de départ et d'arrêt est un étirement continu de codons qui peuvent être traduits en protéine.

4. Cadre de lecture: Les ORF sont lus dans un cadre de lecture spécifique, ce qui signifie que les codons sont regroupés dans des ensembles de trois nucléotides.

signification des ORF:

* Synthèse des protéines: Les ORF fournissent les informations génétiques nécessaires à la synthèse des protéines.

* Identification du gène: L'identification des ORF est une étape cruciale dans la prédiction et l'annotation des gènes.

* Analyse fonctionnelle: L'analyse des ORF peut aider à déterminer la fonction des gènes.

* Études évolutives: Les ORF jouent un rôle dans la compréhension des relations évolutives entre les organismes.

Trouver ORFS:

Les ORF sont généralement identifiés à l'aide d'outils bioinformatiques qui recherchent les fonctionnalités suivantes:

* Démarrer et arrêter les codons

* longueur de séquence codante

* Homologie de séquence aux gènes connus

Exemple:

`` '

... ATGGTGCAAGGTTACGTGTAG ...

`` '

Dans cette séquence, l'ORF est:

* Démarrer le codon: Août

* Stop Codon: Uag

* Séquence de codage: Atggtgcaaggttacgtgt

Remarque:

* Tous les ORF ne sont pas traduits en protéines. Certains ORF peuvent être non codants ou peuvent coder pour des ARN codants non protéiques.

* La longueur et la séquence d'un ORF peuvent varier considérablement entre les gènes.

* Le concept d'ORFS est essentiel pour comprendre l'expression des gènes et la fonction des protéines.