* Enregistrement fossile: Les fossiles fournissent une preuve directe des formes de vie passées et de leur histoire évolutive. Ils peuvent révéler l'ordre chronologique d'apparence de différents phyla et aider à retracer leur lignée.
* Anatomie comparative: La comparaison des structures anatomiques de différents phyla peut révéler des similitudes et des différences qui suggèrent une ascendance commune ou une évolution convergente. Par exemple, la présence d'une notocorde dans les chordés suggère un ancêtre partagé avec d'autres phyla qui possèdent cette structure.
* biologie moléculaire: La comparaison des séquences de l'ADN, de l'ARN et des protéines peut fournir des preuves puissantes des relations évolutives. En analysant les différences et les similitudes dans ces molécules, les scientifiques peuvent reconstruire des arbres phylogénétiques qui montrent l'histoire évolutive de différents phyla.
* Biologie du développement: La comparaison du développement embryonnaire de différents phyla animaux peut révéler des similitudes dans les voies de développement, suggérant une ascendance partagée. Par exemple, la présence d'un stade de blastula dans de nombreux phyla animaux indique une origine de développement commune.
* Biogeography: La distribution géographique des phyla animale peut fournir des indices sur leur histoire évolutive. Par exemple, la distribution des marsupiaux en Australie suggère qu'ils ont évolué isolément des autres mammifères.
Il est important de noter que ces différentes lignes de preuve sont souvent utilisées en combinaison pour fournir une compréhension complète des relations évolutives entre les phyla animale. Le domaine de la biologie évolutive évolue constamment à mesure que de nouvelles preuves émergent et que les techniques analytiques s'améliorent.
