1. Analyse de liaison:
* Fréquence de recombinaison: C'est la pierre angulaire de la cartographie génétique.
* comment cela fonctionne:
* Pendant la méiose, les chromosomes échangent du matériel génétique (traversant) créant de nouvelles combinaisons d'allèles.
* Les deux gènes plus proches sont sur un chromosome, moins ils sont susceptibles d'être séparés en traversant.
* La fréquence de recombinaison (à quelle fréquence les gènes sont séparés) est directement lié à la distance entre eux.
* Données: Vous devez analyser la progéniture à partir de croix pour déterminer la fréquence de recombinaison entre les paires de gènes.
2. Mappage physique:
* Les distances physiques sont mesurées en paires de bases. Cette méthode analyse directement les séquences d'ADN.
* Types de données:
* Polymorphismes de longueur de fragment de restriction (RFLP): Différences dans la séquence d'ADN qui affectent où les enzymes de restriction coupent l'ADN.
* Polymorphismes en nucléotide (SNP): Variations de paires de bases uniques dans les séquences d'ADN.
* Microsatellites: Séquences d'ADN répétitives qui varient en longueur, fournissant des marqueurs pour la cartographie physique.
* Données de séquence: Séquençage direct de l'ADN pour déterminer l'ordre exact des nucléotides.
3. Autres techniques:
* Bandage chromosomique: Cette méthode utilise des colorants pour visualiser les modèles de bandes sur les chromosomes. Bien qu'il ne soit pas précis, il peut fournir des emplacements généraux pour les gènes dans les régions chromosomiques.
* Hybridation in situ par fluorescence (poisson): Les sondes fluorescentes ciblent des séquences d'ADN spécifiques. Cela vous permet de visualiser où un gène est situé sur un chromosome.
Considérations clés:
* Résolution: La cartographie physique fournit des emplacements de gènes plus précis que l'analyse de liaison.
* Techniques complémentaires: Souvent, une combinaison d'approches est utilisée pour obtenir une compréhension plus complète des positions génétiques.
Exemple:
Imaginez que vous cartographiez trois gènes (A, B et C) sur un chromosome.
* Analyse de liaison: Vous pourriez constater que le gène A et le gène B se recombinent à une fréquence de 10%, tandis que le gène B et le gène C se recombinent à une fréquence de 2%. Cela suggère que A et B sont plus éloignés que B et C.
* Mappage physique: Vous pourriez ensuite séquencer la région d'ADN contenant ces gènes et constater que A et B sont séparés par 100 000 paires de bases, tandis que B et C sont séparés par 20 000 paires de bases. Cela confirme les distances relatives établies par l'analyse de liaison.
Faites-moi savoir si vous souhaitez plus de détails sur l'une de ces méthodes ou si vous avez d'autres questions!
