Ce terme englobe un large éventail d'organismes unicellulaires ou multicellulaires qui sont trop petits pour être vus à l'œil nu, notamment:

* bactéries

* Archaea

* champignons

* Protozoa

* algues

* virus (bien que techniquement pas considéré comme des organismes vivants)

Certains autres termes connexes incluent:

* Microbes: Il s'agit d'un terme plus informel souvent utilisé de manière interchangeable avec des micro-organismes.

* microflore: Ce terme fait spécifiquement référence aux micro-organismes qui vivent dans un environnement particulier, comme l'intestin humain.

* microfaune: Ce terme se réfère spécifiquement aux animaux microscopiques.

Ainsi, bien que les «micro-organismes» soient le terme le plus précis et le plus scientifique, vous pouvez rencontrer d'autres termes connexes en fonction du contexte spécifique.