1. Établir la racine de l'arbre:
* Un groupe extérieur est un taxon connu pour être moins étroitement lié à l'introduction (les taxons à l'étude) que n'importe lequel des taxons ingroup les uns aux autres.
* Il fournit un point de référence à déterminer la direction du changement évolutif .
* En comparant l'introduction au groupe externe, nous pouvons identifier quels traits sont ancestraux et qui sont dérivés, ce qui nous permet de rooter l'arbre phylogénétique.
* Ceci est essentiel pour comprendre l'histoire évolutive de l'introduction.
2. Éviter les topologies d'arbres incorrectes:
* Sans groupe extérieur, les algorithmes phylogénétiques peuvent produire des arbres qui ne sont pas enracinés ou qui ont des schémas de ramification incorrects.
* En effet, les algorithmes ne peuvent pas distinguer les traits ancestraux et dérivés sans point de référence.
* Un groupe extérieur aide à réduire le risque d'interpréter les relations évolutives .
3. Détection d'attraction à longueur longue:
* L'attraction à longue branche (LBA) est un phénomène où les taxons avec de longues branches évolutives (lignées en évolution rapide) sont incorrectement regroupées, même si elles ne sont pas étroitement liées.
* Un bon groupe extérieur peut aider à réduire les chances de LBA . En effet
En résumé, bien qu'il soit techniquement possible d'effectuer une analyse phylogénétique sans groupe externe, cela peut conduire à des résultats inexacts. L'utilisation d'un groupe extérieur approprié améliore considérablement la précision et l'interprétabilité de l'arbre phylogénétique.
Considérations pour le choix d'un groupe extérieur:
* lié: Le groupe extérieur doit être suffisamment lié à partager certains caractères homologues avec le groupe, mais pas si étroitement lié qu'il est indiscernable de l'ingroup.
* Disponibilité des données: Le groupe extérieur doit avoir des données suffisantes (morphologique, génétique ou autre) pour permettre des comparaisons significatives.
* Histoire évolutive connue: L'histoire évolutive du groupe extérieur devrait être raisonnablement bien compris.
Rappelez-vous: Il n'y a pas de groupe externe "parfait"; Le choix dépend des taxons spécifiques à l'étude et des données disponibles.
