En 1665, il a utilisé un microscope pour observer une fine tranche de liège et a remarqué de petits compartiments en forme de boîte qu'il a nommés "cellules" parce qu'ils lui rappelaient les cellules d'un monastère.
Bien que Hooke ne voyait pas vraiment de cellules vivantes, sa découverte a jeté les bases du développement de la théorie des cellules, qui indique que tous les organismes vivants sont composés de cellules.