1. Analyses moléculaires:
* Comparaisons de séquences d'ARN ribosomal (ARNr): Ceci est considéré comme l'outil le plus important pour déterminer les relations évolutives. L'ARNr est une molécule fondamentale impliquée dans la synthèse des protéines, et sa séquence est hautement conservée dans toutes les formes de vie. Les comparaisons des séquences d'ARNr ont révélé des différences profondes entre les bactéries, les archées et l'eucarya, suggérant des divergences évolutives profondes.
* Séquençage du génome et génomique comparative: L'analyse des séquences d'ADN complètes d'organismes permet des comparaisons détaillées de la teneur en gènes, de l'ordre des gènes et d'autres caractéristiques génomiques. Cela a encore renforcé la distinction entre les trois domaines et a révélé des relations évolutives surprenantes au sein de chacune.
2. Analyses cellulaires:
* Structure cellulaire: Bien que tous les organismes aient des cellules, les différences structurelles entre les bactéries, les archées et l'eucarya sont significatives. Les bactéries et les archées sont généralement procaryotes (sans noyau et autres organites liés à la membrane), tandis que les eucarya sont eucaryotes (ayant un noyau et d'autres organites).
* Composition de la paroi cellulaire: Les bactéries, les archées et l'eucarya ont des compositions de paroi cellulaire distinctes. Par exemple, les bactéries ont souvent du peptidoglycane dans leurs parois cellulaires, tandis que les archées ont différents types de polysaccharides.
* Pathways métaboliques: Les processus métaboliques qui se produisent dans les cellules diffèrent significativement entre les domaines, reflétant les adaptations à divers environnements et modes de vie.
Il est important de noter:
* Le système à trois domaines est le modèle actuel accepté, mais c'est un domaine d'étude dynamique.
* Plus de recherches peuvent entraîner des modifications ou des raffinements du système à mesure que de nouvelles données apparaissent.
En résumé, le regroupement des organismes modernes dans des domaines est basé sur une analyse complète de leurs caractéristiques moléculaires et cellulaires, offrant un cadre robuste pour comprendre la diversité et l'histoire évolutive de la vie sur Terre.