1. groupe de phosphate: Il s'agit d'un groupe chargé négativement qui donne aux nucléotides leurs propriétés acides. Il est également important pour les fonctions de stockage et de transfert d'énergie des nucléotides.

2. Groupe de sucre: Il s'agit d'un sucre à cinq carbones, soit du ribose (dans l'ARN) ou du désoxyribose (dans l'ADN). Le sucre fournit la structure de la squelette du nucléotide et permet la fixation de la base.

3. base azotée: Il s'agit d'une structure de cycle hétérocyclique contenant des atomes d'azote. Il existe cinq principaux types de bases azotés:l'adénine (A), la guanine (G), la cytosine (C), la thymine (T) et l'uracile (U). La base spécifique attachée au sucre détermine l'identité du nucléotide.

Ces trois groupes fonctionnels sont liés entre eux pour former une molécule de nucléotide unique. Le groupe phosphate est attaché au carbone de 5 'du sucre, la base azotée est attachée au 1' carbone du sucre, et le groupe hydroxyle au 3 'carbone du sucre est disponible pour se lier au groupe phosphate du nucléotide suivant dans une chaîne.