Cependant, il existe un autre mouvement moins important de protons qui contribue également au gradient de protons:
* de l'espace intermembranaire au stroma: Cela se produit via canaux de fuite de protons dans la membrane chloroplastique intérieure. Ce mouvement est moins efficace que le primaire à travers la membrane thylakoïde, et sa contribution au gradient de protons est relativement faible.
Il est important de se rappeler que la chimiosmose dans les chloroplastes est principalement entraînée par le gradient de proton à travers la membrane thylakoïde . Le mouvement des protons de l'espace intermembranaire au stroma est un processus secondaire qui contribue dans une moindre mesure.
