L'activité biologique peut modifier la quantité d'eau dans l'atmosphère. Par exemple, les plantes rejettent de la vapeur d’eau dans l’atmosphère par le processus de transpiration. Cette vapeur d’eau peut alors se condenser pour former des nuages ​​et des précipitations. De plus, l’activité biologique peut également affecter la quantité d’eau présente dans le sol. Par exemple, les racines des plantes peuvent aider à retenir l’eau dans le sol, tandis que les activités des vers de terre et d’autres organismes peuvent contribuer à aérer le sol et à améliorer le drainage. L'activité biologique peut également affecter la quantité d'eau dans les océans. Par exemple, la croissance des récifs coralliens peut contribuer à protéger les côtes de l’érosion et des dégâts causés par les tempêtes.