L'adénine est une base purique et, en tant que telle, elle contient les groupes fonctionnels suivants :

- Deux groupes amino (-NH2) :Un groupe amino est situé en position 6 du cycle purine, et l'autre est situé en position 1.

- Un cycle imidazole :Le cycle imidazole est un hétérocycle aromatique à cinq chaînons qui contient deux atomes d'azote et un atome de carbone. Il est situé aux positions 4, 5 et 7 du cycle purine.

- Une double liaison carbone-azote (C=N) :La double liaison carbone-azote est située entre les positions 8 et 9 du cycle purine.