1. Emballage d'ADN à médiation protéique :
- Dans certains virus à ADN, comme les bactériophages comme le phage T4, le génome est encapsidé dans la capside grâce à l'action de protéines spécialisées. Ces protéines, appelées ATPases d’emballage d’ADN, se lient à des séquences d’ADN spécifiques et utilisent l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP pour pousser la molécule d’ADN dans la capside.
2. Mise en file d'attente :
- Le spooling est un mécanisme observé dans certains virus à ARN, comme le VIH-1. Lors de l’assemblage viral, le génome de l’ARN est activement transcrit en une longue molécule d’ARN simple brin. Cette molécule d’ARN est ensuite enroulée dans une structure conique ou cylindrique, guidée par des protéines de nucléocapside. L’ARN spoolé forme un noyau compact entouré par la capside virale.
3. Enroulage et empilage :
- Dans certains virus, le génome est conditionné par une combinaison d'interactions d'enroulement et d'empilement. Par exemple, dans les virus de l’herpès, le génome de l’ADN double brin s’enroule et forme une structure toroïde ou annulaire. Cet ADN toroïdal est en outre stabilisé par des interactions avec des protéines virales, permettant au génome de s'adapter efficacement à la capside.
4. Structures de type nucléosome :
- Certains virus à ADN, comme les adénovirus, emballent leur génome dans des structures ressemblant à des nucléosomes, qui sont des complexes protéine-ADN présents dans les cellules eucaryotes. L'ADN viral s'associe aux histones virales, formant des particules semblables à des nucléosomes qui condensent le génome et le protègent de la dégradation.
5. Glycoprotéines :
- Les glycoprotéines présentes sur l'enveloppe virale peuvent contribuer à la condensation du génome de certains virus. En interagissant avec le génome viral, ces glycoprotéines aident à organiser et à stabiliser le matériel génétique au sein du virion.
6. Enveloppes et coquilles protéinées :
- Dans certains virus comme le rotavirus, une enveloppe protéique peut envelopper le noyau d'acide nucléique condensé. Cette enveloppe protéique est flexible et permet au noyau de se condenser et de se développer, garantissant ainsi l’efficacité de la réplication et de la transmission virales.
7. Transition de phase :
- Dans certains virus à ARN comme le virus de la grippe A, les chercheurs ont proposé que le génome subisse une transition de phase de l'état liquide à l'état gel lors de l'emballage. Un tel changement d’état permet au génome d’adopter un arrangement compact et ordonné.
Il est important de noter que les mécanismes spécifiques de condensation du génome peuvent varier en fonction des espèces virales, de la structure du génome et des voies d'assemblage. La capacité des virus à regrouper efficacement leurs informations génétiques dans un espace confiné est essentielle à leur survie, leur réplication et leur transmission dans différents environnements et hôtes.
