Dans les années 1940 environ, quelqu'un dans ce qui est aujourd'hui le Département de Pathobiologie et des Sciences Vétérinaires s'est procuré un lyophilisateur, un équipement qui lyophilise les échantillons, explique le directeur du Laboratoire de diagnostic médical vétérinaire du Connecticut (CVMDL)
Le Dr Guillermo Risatti explique qu'à cette époque, le laboratoire de microbiologie était très actif dans l'analyse du lait destiné aux fermes laitières de la région. Avec un nouvel équipement passionnant, il semble qu'ils aient commencé à lyophiliser des centaines d'échantillons.
Depuis, les échantillons sont stockés. Peu de détails sur les échantillons de lait ont montré qu'ils contenaient des bactéries Streptococcus datant des années 1940.
Risatti explique que lui et ses collègues – le Dr Zeinab Helal, associé de recherche au CVMDL, Ji-Yeon Hyeon (maintenant au Collège de médecine vétérinaire, Université Konkuk, Séoul, République de Corée) et Dong-Hun Lee (également maintenant au Collège de médecine vétérinaire) Medicine, Konkuk University, Séoul, République de Corée) – souhaitaient explorer leur histoire microbienne.
Risatti dit qu'au fil des années, les données ont été perdues, de sorte que les chercheurs ne disposent pas de détails précis sur la provenance des échantillons. Mais connaissant un peu l'histoire du département, ils peuvent en déduire quelques informations.
"Nous pensons que la plupart d'entre eux provenaient du Connecticut ou peut-être de cas de la région, mais nous ne pouvons pas dire de quelles parties", dit Risatti. "Très probablement, ce laboratoire fournissait un service de tests aux locaux, car il s'agissait principalement d'un laboratoire de pathologie. Maintenant, cela ressemble plus à un laboratoire de diagnostic, et nous recevons des échantillons de toute la région, y compris de New York et du New Jersey."
Apprendre ce que contiennent ces échantillons historiques pourrait aider la recherche de manière inattendue, mais la première étape consiste à reconstituer les détails perdus. Pour ce faire, Risatti explique que l'équipe a établi un flux de travail utilisant des techniques standard pour rationaliser les processus d'analyse des caractéristiques visuelles, appelées phénotype, et pour analyser leur génotype avec séquençage génomique.
Différentes espèces de Streptococcus utilisent différentes stratégies pour infliger des maladies aux organismes qu'elles infectent. Ces facteurs de virulence sont utilisés pour différencier une espèce de Streptococcus d’une autre et constituent un moyen de distinguer les échantillons grâce à l’analyse phénotypique. Une autre analyse phénotypique consiste à tester les bactéries pour déterminer leur sensibilité aux antibiotiques.
Les chercheurs ont commencé avec 50 échantillons collectés entre 1941 et 1947 et ont découvert que les échantillons contenaient sept espèces différentes de Streptococcus, dont deux sous-espèces de S. dysgalactiae.
Fait intéressant, les chercheurs ont découvert que certains des échantillons étaient résistants à l'antibiotique tétracycline et ne portaient pas les gènes de résistance aux antibiotiques généralement observés dans les souches bactériennes résistantes aux antibiotiques d'aujourd'hui.
Étant donné que ces échantillons ont été collectés avant l'ère des antibiotiques, les résultats s'ajoutent à un nombre croissant de publications montrant que la résistance aux antibiotiques se produisait naturellement avant que les humains ne découvrent et ne commencent à utiliser les antibiotiques.
"La résistance aux antibiotiques est un domaine de recherche très important, et ce depuis de nombreuses années", explique Risatti. "Nous ne sommes pas allés plus loin dans notre analyse parce que nous n'avons pas les outils ici, mais nous espérons apporter cette information au public. Je pense que cela pourrait être un tremplin pour que quelqu'un puisse approfondir ses études."
Risatti explique que son espoir est de s'associer à de grandes agences comme le CDC et le ministère de la Santé publique pour aider à renforcer la recherche sur la résistance aux antibiotiques.
Dans le développement du flux de travail, Risatti a également salué le travail des étudiants Jillian Baron '24 (CAHNR) et Patricia Arceta '24 (CAHNR). "C'est une bonne plateforme permettant aux étudiants de premier cycle d'acquérir de l'expérience et de publier leurs découvertes. Je suis surpris par l'enthousiasme de ces jeunes. Je suis heureux que nous puissions fournir l'espace nécessaire pour faire ces choses."
Tourné vers l'avenir, Risatti est enthousiasmé par d'éventuelles collaborations futures :"J'espère que les gens pourront voir un lien entre ce que nous faisons au CVMDL et la santé humaine."
Fourni par l'Université du Connecticut
