Malgré son importance, comprendre la base génétique de ces caractères reste un défi en raison de la complexité du génome de Mentha, caractérisé par une forte hétérozygotie et de nombreuses variations structurelles. Une étude approfondie du génome de Mentha était essentielle pour découvrir les facteurs génétiques influençant ses caractéristiques uniques.

Des chercheurs de l'Université de médecine traditionnelle chinoise de Chengdu, en collaboration avec plusieurs autres institutions, ont réussi à assembler un génome sans lacunes et résolu par haplotype de Mentha suaveolens, également connu sous le nom de menthe ananas.

Utilisant des technologies de séquençage avancées, l’équipe a mis en lumière la diversité génétique et les variations structurelles au sein du génome, fournissant ainsi une ressource précieuse pour les futures recherches en génétique et en sélection. L'étude est publiée dans la revue Horticulture Research .

L'étude présente le premier assemblage génomique de haute qualité résolu par haplotype pour Mentha suaveolens, avec une taille de génome de 414,3 Mo et 31 251 gènes codants. En intégrant les données de diverses plates-formes de séquençage, les chercheurs ont résolu deux assemblages haplotypiques complets, chacun presque entièrement annoté pour les télomères et les centromères.

L'analyse a notamment révélé 41 135 variations structurelles, notamment des délétions, des insertions, des duplications et des translocations, dont beaucoup ont un impact sur les gènes impliqués dans la biosynthèse des terpénoïdes.

Une découverte significative est la prédominance de l'oxyde de pipériténone parmi les composés volatils produits par M. suaveolens, par opposition au menthol, qui est plus courant chez d'autres espèces de Mentha.

L'étude a identifié trois gènes codant pour l'isopériténone réductase (ISPR), une enzyme clé dans la biosynthèse du menthol, mais a révélé que leurs faibles niveaux de transcription conduisaient probablement à l'accumulation d'oxyde de pipériténone.

Le Dr Chi Song, l'un des principaux chercheurs, a déclaré :« L'achèvement du génome sans lacune de Mentha suaveolens représente une étape importante dans la génomique végétale. Cette carte génétique complète fournit une base pour l'exploration des mécanismes moléculaires qui sous-tendent les propriétés uniques de Mentha suaveolens. menthe ananas, ce qui pourrait conduire à des applications innovantes en médecine et en agriculture."

L'assemblage sans faille du génome de Mentha suaveolens ouvre la voie à la recherche génétique et à la sélection pour améliorer ses qualités médicinales et aromatiques. Comprendre la base génétique de la biosynthèse des terpénoïdes permet des stratégies ciblées pour optimiser des composés précieux comme l'oxyde de pipériténone.

Cette recherche fait progresser la génomique végétale et présente un potentiel important pour améliorer la culture et la valeur commerciale des espèces de Mentha.