Les chercheurs de l'Iowa State University ont créé une base de données en ligne accessible qui met en évidence les données génomiques critiques d'un simple clic de souris.

Dans un article publié aujourd'hui dans la revue Rapports scientifiques , une équipe de chercheurs de l'Iowa State University a présenté une nouvelle base de données qui permet aux scientifiques d'accéder rapidement aux informations sur les structures d'ARN codées dans le génome humain. La base de données est librement accessible à tous sur le web, où il permet aux scientifiques d'étudier les fonctions et la structure de l'ARN plus rapidement et plus facilement que par le passé. Cela facilitera la recherche fondamentale en biologie humaine et pourrait ouvrir la voie à de nouveaux traitements médicaux ciblant l'ARN, dit Walter Moss, professeur adjoint au département de biochimie Roy J. Carver, Biophysique et biologie moléculaire.

ARN, abréviation d'acides ribonucléiques, sont des chaînes moléculaires qui sont transcrites, ou copié, du génome. Les ARN peuvent être porteurs d'informations, agissant comme intermédiaires entre l'ADN et la protéine, ou en tant que molécules fonctionnant indépendamment qui interviennent dans de nombreux processus régulateurs critiques. Contrairement à l'ADN, L'ARN peut « se replier » sur lui-même pour former des structures qui rivalisent avec les protéines dans leur complexité. Ce repliement joue un rôle clé dans la fonction de l'ARN, ainsi obtenir des informations structurelles sur l'ARN peut fournir des informations importantes sur notre compréhension du fonctionnement des organismes, dit Mousse.

"L'ARN est fondamental pour comprendre la biologie, et les progrès de la technologie de séquençage ont conduit à une explosion de la liste des ARN potentiellement fonctionnels, " il a dit.

Par exemple, alors que seulement 2% environ des 3,5 milliards de paires de bases de l'ADN humain codent pour des protéines, plus de 70 pour cent est transcrit en ARN. Comprendre les fonctions de cet océan d'ARN inexploré pose un défi scientifique majeur, et la nouvelle base de données fournit des outils essentiels pour la cartographier, dit Mousse.

Mousse, avec l'étudiant diplômé Ryan Andrews et le directeur informatique de la recherche Levi Baber, fragmenté l'ensemble du génome humain en plus de 154 millions de fenêtres qui se chevauchent et calculé une gamme de mesures utiles pour comprendre comment l'ARN se replie.

« Tout le monde dans le monde peut désormais récupérer en un clic ce qui prenait autrefois des heures de calculs pour déterminer, ", a déclaré Andrews.

ARN thérapeutique, une nouvelle approche en médecine dans laquelle l'ARN est ciblé avec des médicaments plutôt que des protéines, montrer de grandes promesses, et la base de données structurelle détaillée dans la publication fournit un vaste référentiel de pistes thérapeutiques potentielles, dit Mousse.