La résolution d'un microscope est la capacité de distinguer deux objets rapprochés. Elle est déterminée par la longueur d'onde de la lumière utilisée et l'ouverture numérique de l'objectif. L'ouverture numérique est une mesure de la quantité de lumière collectée par l'objectif.

Le grossissement d'un microscope est le rapport entre la taille de l'image et la taille de l'objet. Elle est déterminée par la distance focale de l'objectif et la distance focale de l'oculaire.

Ainsi, un microscope qui agrandit un objet 400 fois n'a pas nécessairement une résolution de 400. La résolution du microscope dépendra de la longueur d'onde de la lumière utilisée et de l'ouverture numérique de l'objectif.