Crédit :Laboratoire national du Nord-Ouest du Pacifique
La collecte d'ensembles de données à partir de campagnes de terrain laborieuses semble être plus difficile que de trouver et de comparer les données de différentes campagnes. Malheureusement, ce n'est souvent pas le cas. Selon le scientifique de la Terre Jinshi Jian, du Pacific Northwest National Laboratory (PNNL), « Assembler des ensembles de données à des fins de comparaison est un travail difficile et chronophage. Unités, conventions, nomenclatures - beaucoup de choses peuvent varier de manière confuse." Les données peuvent également être inaccessibles derrière des paywalls ou impossibles à télécharger.
Ces problèmes existent dans la plupart des domaines, mais une collaboration entre chercheurs travaillant sur des mesures des échanges gazeux entre le sol et l'atmosphère réalisées par des systèmes automatisés, également appelées mesures de flux sol-atmosphère ou respiration du sol, déplace leur domaine vers une solution.
Comprendre comment les niveaux de gaz entrant et sortant du sol changent en réponse aux changements de l'atmosphère est crucial pour obtenir une image complète de l'évolution du cycle mondial du carbone et des changements climatiques qui en résultent. Les jeux de données mesurés sur le terrain se concentrent souvent sur une zone géographique très spécifique et présentent de larges problèmes de compatibilité de formatage, mais les assembler pour créer un ensemble de données plus global pourrait fournir de larges informations biogéochimiques.
Pour faire avancer la science, un groupe mondial de chercheurs de plus de 70 institutions a contribué à la base de données COSORE (abréviation de CONtinuous SOil Respiration) dans le but de créer une vaste ressource contenant des ensembles de données normalisées sur les flux de sol du monde entier qui ont été convertis en une forme utile pour les chercheurs. Dans un effort mené par Ben Bond-Lamberty du PNNL, COSORE a été lancé le mois dernier avec plus de 8 millions de points de données disponibles. Selon Bond-Lamberty, les membres de la communauté des chercheurs sont déjà enthousiasmés par le projet.
La création d'une base de données utilisable a nécessité une collaboration entre des chercheurs de plus de 70 institutions à travers le monde. Crédit :Ben Bond-Lamberty | Laboratoire national du nord-ouest du Pacifique
Créer un package accessible pour les étudiants et les chercheurs
Il y a une décennie, Bond-Lamberty a travaillé sur un projet similaire et a créé une base de données (la Soil Respiration Database ou SRDB) de mesures de flux annuels qui a été largement utilisée depuis sa création. La création de SRDB a fourni des leçons précieuses sur la conception de bases de données et l'utilité d'un grand référentiel de données, qui a façonné sa philosophie en construisant COSORE.
Le processus de création de COSORE a été assez rapide. Bond-Lamberty a fait passer l'idée de sa conception à sa publication en environ dix-huit mois, un délai d'exécution rapide pour un si grand projet.
« Une philosophie directrice de la construction de COSORE était de la rendre robuste et de haute qualité, mais aussi de ne pas laisser le parfait être l'ennemi du bien. Je voulais m'assurer que le package était utilisable et accessible aux scientifiques avec un éventail de compétences statistiques et de programmation, " dit Bond-Lamberty.
La convivialité de COSORE a été mise à l'épreuve cet été. Bond-Lamberty a travaillé avec un stagiaire du secondaire au cours de l'été qui a utilisé le package pour examiner la sensibilité à la température des flux de gaz sol-atmosphère, en accordant une attention particulière aux différences selon l'emplacement et le cycle jour/nuit.
COSORE dispose d'ensembles de données de différentes régions du globe, y compris des emplacements en Amérique du Nord, Europe de l'Ouest, et la Chine, qui permettent aux utilisateurs de comparer les tendances dans ces régions. Crédit :Ben Bond-Lamberty | PNNL
Un référentiel communautaire pour de nouvelles directions de recherche
Un avantage particulier de COSORE est qu'il crée de nouvelles possibilités de recherche. La plupart des ensembles de données qu'il détient sont si spécialisés que, par eux-même, seul un petit groupe de chercheurs s'y intéresserait. Cependant, en combinant ces ensembles de données, COSORE permet aux utilisateurs de comparer les tendances dans différentes régions du monde, potentiellement fournir de nouvelles informations uniques.
L'élargissement du nombre d'ensembles de données disponibles n'est qu'un des avantages de COSORE. Disposer d'un référentiel central permet de protéger le domaine scientifique de la perte des données de flux, même si les données sous-jacentes disparaissent à cause de chaînes de stockage et de messagerie brisées. Finalement, Nous espérons que COSORE accélérera la science en épargnant aux chercheurs le temps et les efforts nécessaires pour assembler des ensembles de données disparates.
Bond-Lamberty espère que COSORE continuera de croître à mesure que les chercheurs soumettront davantage de données modélisées à la base de données. Ensembles de données provenant d'emplacements en Amérique du Nord, Europe de l'Ouest, et la Chine dominent la base de données, laissant des lacunes dans d'importantes régions tropicales. Au fur et à mesure que de nouveaux ensembles de données de régions importantes sont collectés, COSORE peut les mettre à la disposition des chercheurs du monde entier qui peuvent utiliser la ressource pour faire avancer leur science.
